基于深度学习的癌症治疗反馈预测

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:windcode2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来随着医疗技术的不断发展,越来越多的患者在患癌早期被发现确诊,一些常见癌症的死亡率逐年下降。由于癌症的治疗并不适用普适性治疗,同样的药物对于不同的患者而言有着不同的治疗效果。个性化癌症药物反应预测需求应此而生。围绕着机器学习技术开发新的模型以解决药物反应预测,已经成为了人们关注的新热点。本文围绕着个性化药物反应预测任务中基因库数据与临床数据之间的数据偏移问题,使用夏普利值(Shapley Value)来对差异基因特征进行特征选择,加强训练模型的泛化能力。同时整合了使用进化算法进行优化的参数自适应优化机制,提出了面向个性化药物反应预测的参数自适应机器学习框架MR.DRP(Mr.Drug Response Predictor),具体如下:本文首次关注到药物反应预测任务走向临床时需要面对的关键问题:基因库数据与临床数据之间的数据偏移。通过提出基于夏普利值的特征选择来缓和数据偏移现象。并在顺铂(Cisplatin)药物数据集和紫杉醇(Paclitaxel)药物数据集上,开展了一系列分析实验。实验结果表明,基于夏普利值的特征选择方法成功关注到基因库数据与临床数据上存在分布差异的基因。随后通过协方差矩阵自适应进化算法来对可能的参数解空间进行搜索。基于搜索得到的最优解训练模型并在临床数据上进行了验证。结果表明本文提出的参数自适应机器学习框架MR.DRP相比其他传统机器学习模型取得了最好的预测结果。最后,本文对网络模型最重要的部分特征进行了富集性分析,指出了部分影响判断药物反应的重要通路。
其他文献
在饲养剖腹产净化后的KM(昆明)种群时,我们发现了一些后肢畸形的动物。通过挑选后已成为一个稳定遗传的突变株。由于此群体产生的后代100%均为后肢畸形动物,因此可以认定为Id/Id纯合子动物,命名为KM—ld小鼠。我们对KM—Id成年小鼠进行了解剖病理学的分析,发现KM—Id后肢畸形主要表现为后肢骨缺失,胫骨无腓骨支撑而弯曲。至使后肢向外翻。趾掌骨无法着地,只能以膝关节着地支撑躯体。少数动物表现为胫
现代社会的发展对于企业提出更高的要求,要想在变幻莫测的市场竞争体系中长久立足,要做好业财融合。业财融合是指将财务部门和业务部门有效地结合在一起,进而满足各项管理工作需求,可以说,业财融合开展也具有重要的意义,不仅可以促进企业发展,也能够帮助企业实现战略目标。相关数据表明,业财融合中仍旧存在着问题,所以本文针对问题提出几点优化策略,希望可以帮助企业更好地展开管理,从而提高经济利润和社会收益。
<正> 我曾两次奉派到美国进行实验动物科学考察,现将考察情况以及个人的想法略述如下。在近代生物医学研究领域里,有人把实验研究所需要的条件归纳为四条:一为实验动物(Animal);二为设备(Equipment);三为信息(Informafion);四为试剂(Rea-
期刊
<正> 我院对晚期肝硬化进行了中西医结合分阶段治疗,以中医辨证论治为主,西药大剂量短期冲击利尿为辅,取得了一定疗效。现将资料完整的50例临床治疗体会,小结如下:
期刊
<正>近日,来自四川大学的研究者在Signal Transduction and Targeted Therapy杂志上发表了题为“Artificial intelligence in cancer target identification and drug discovery”的综述性文章,该研究揭示了人工智能模型为我们研究网络特征与癌症之间的关系及发现新的候选药物提供了一个定量框架。目前的大
期刊
基于2011—2020年的广西人口数据,本研究在MATLAB软件中运用BP神经网络和时间序列ARIMA模型对2021—2036年的广西农村人口、城镇人口和年末常住人口进行了预测.通过BP神经网络和ARIMA模型构造图形,经图形拟合度的分析,本研究发现BP神经网络预测效果良好,精度较高,这有助于预测今后一段时间人口的变化,能为有关部门制定相应的人口政策提供参考.
<正> 你志83年4期"老中医经验"栏载胡源民同志"肝硬化中医治疗三得",文分三节.一、"辨病基础方"即由现代医学确诊为肝硬化后,即投本方治疗,并以中医辨证方法加减进退;二、鸡内金对本病的肝脾肿大、肝组织硬化有强脾健胃、补肾益肝之效,乃治肝硬化不可多得之佳品;三、治腹水甘遂最相宜,有水久用无妨,并强调"有水必逐,逐水务尽.即使在邪实正虚的情况下,也应首先考虑祛邪,切忌投鼠忌器,而姑息养奸."现就笔
期刊
目的:分析老年糖尿病(diabetes mellitus,DM)合并社区获得性肺炎(community acquired pneumonia,CAP)以及老年糖尿病合并重度社区获得性肺炎患者临床一般资料、实验室检验、胸部影像学检查特点以及预后情况;探索中性粒细胞与淋巴细胞比值(neutrophil/lymphocyte ratio,NLR)、降钙素原(procalcitonin,PCT)、血清淀粉
我国是农业大国,农业作为国之根本对于国家发展有着至关重要的作用。促进农村经济增长、增加农民收入与提升农民获得感,历来都是党和政府工作的重点。农村金融高质量发展为农村经济增长注入新的活力,助力全面实现乡村振兴战略。研究发现,我国农村金融目前存在征信体系不完善、金融服务落后、金融法律制度不完善以及金融科技与信息支撑手段落后等几个方面的问题。因此,应建立完整的农村地区征信体系,加强农村金融服务建设,建立
目的:研究电针通过调控大鼠腰椎间盘线粒体自噬,抑制腰椎间盘退变(LIDD)的作用及机制。方法:60只雄性SD大鼠随机分为4组:假手术组、模型组、电针组和假电针组,每组15只。除假手术组外,其余各组均根据脊柱失稳原理构建大鼠LIDD模型。电针组选取双侧L3~5夹脊穴进行电针干预治疗4周;假电针组治疗同电针组但不通电;假手术组与模型组在电针组与假电针组进行治疗时,均施加同等时间及强度的约束。观察椎间盘