大麦HvPrpl基因的克隆和表达模式分析

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利用基因克隆方法,首次从大麦中扩增出并获得HvPrp1基因序列,通过荧光定量PCR技术及表达谱芯片技术,对大麦、拟南芥和水稻中的Prp1基因表达模式进行了比较分析,并对该基因的分子作用机制进行了推测。主要研究结果如下:   1.克隆得到大麦HvPrp1基因,片段大小为3909bp,编码一个由857个氨基酸组成的蛋白质。将其基因序列与水稻和拟南芥的.Prp1基因序列进行比对后发现,基因序列同源性分别达到87%和78%,氨基酸序列同源性分别达到94%和79%。蛋白结构域分析发现,该氨基酸序列具有Prp1蛋白家族的保守结构域,包括N端结构域和C端的TPR和HAT结构。据此推测,克隆得到的基因是编码大麦Prp1蛋白的基因。   2.利用荧光定量PCR对大麦根、茎、叶中的HvPrp1基因表达模式进行分析,发现HvPrp1基因在三种组织中均表达且表达量相同。在种子发育过程中,胚成熟时期表达量达到最大。在低温胁迫下,HvPrp1基因明显上调表达。通过对Prp1基因在大麦、水稻和拟南芥中的基因表达谱数据分析,发现Prp1基因在这三个物种中具有相同的表达模式,启动子顺式作用元件预测发现来自于水稻、拟南芥和酵母的启动子共同拥有53个顺式作用元件,将表达谱芯片数据和荧光定量PCR结果进行比较,发现其冷胁迫和储藏蛋白相关的顺式作用元件是有效的。   3.推测植物Prp1基因的功能是通过磷酸化来调节剪接体活性,这种功能很可能和酵母中一样。
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