CⅡTA基因启动子Ⅳ不同单倍型的初步功能研究及其与HBV感染不同转归的相关性分析

来源 :第三军医大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fems0601
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景与目的:乙型肝炎病毒感染的临床表型复杂多样,其形成机制尚未阐明。除了病毒因素外,宿主遗传易感性是一个重要的方面。宿主感染HBV后,MHC-Ⅱ类分子的表达水平直接影响宿主对HBV的免疫应答。CⅡTA是调控细胞表达MHC-Ⅱ类分子及其水平的限速因子,通过调控细胞是否表达MHC-Ⅱ类分子及水平来决定宿主的免疫功能状态,从而影响感染性疾病、自身免疫性疾病、移植排斥及肿瘤的发生、发展及转归。在HBV感染的遗传易感性研究中,疾病的关联研究最常用。国外研究发现CⅡTA基因存在SNPs,并与自身免疫性疾病的易感性相关。我们前期研究发现中国人CⅡTA基因也存在SNPs,其中启动子Ⅳ区有4个。我们选择启动子Ⅳ区等位基因频率较高的2个SNP位点G-944C、T-1350C在HBV感染人群中进行基因分型,探讨CⅡTA启动子Ⅳ区基因多态性是否与HBV感染不同临床表型的形成有关,并对CⅡTA基因启动子Ⅳ区不同单倍型进行初步功能研究。研究对象与方法:在1420例不同临床表型的HBV感染人群和125无HBV感染的正常健康献血员中,采用四引物扩增受阻突变体系PCR技术对CⅡTA启动子Ⅳ区2个SNP位点G-944C和T-1350C进行基因分型,分析每个位点及每种单倍型和基因型在HBV感染不同临床表型人群中的分布频率。然后选取经四引物扩增受阻突变体系PCR分型技术确定的CC/CC、CG/CG、TC/TC和TG/TG基因型患者各1例,分别提取其外周全血细胞DNA作模板,制备CⅡTA基因另外4种单倍型DNA的部分片段,并构建包含4种单倍型启动子Ⅳ区DNA的萤光素酶报告基因表达载体。将2种萤光素酶报告基因空载体和4种单倍型的表达载体分别与pRL-TK内参质粒共转染HepG2细胞,检测插入目的片段前后萤光素酶表达量的变化来反映不同单倍型DNA片段的功能。主要研究结果:一、CⅡTA基因启动子Ⅳ多态性与HBV感染慢性化的关系相对于自限性HBV感染人群,在HBV感染慢性化人群中T-1350C位点的T等位基因和G-944C位点的G等位基因频率较低,而T-1350C位点的C等位基因和G-944C位点的C等位基因在HBV感染慢性化人群中频率显著升高(X2=18.1,18.0;P=6.3×10-5,6.3×10-5).四种单倍型中,慢性HBV持续感染人群中CC单倍型频率较急性自限性HBV感染者高,TG单倍型频率较低(X2=17.3,P=7.9×10-5).非条件logistic回归分析除去年龄和性别影响后发现,慢性HBV持续感染和自限性HBV感染人群之间4组基因型频率分布相差非常显著(OR 0.507;95%CI,0.401-0.642;P=6.9×10-8),而且这种差异主要见于CC/CC与TG/TG基因型之间(OR 0.503;95%CI,0.394-0.641;P=1.7×10-8)。与携带TG/TG基因型者相比,携带CC/CC基因型者感染HBV后更容易慢性化。健康献血员的单倍型及基因型频率介于慢性HBV感染人群和自限性HBV感染人群之间。二、CⅡTA基因启动子Ⅳ多态性与慢性HBV感染者疾病表型间的关系4种单倍型在慢性无症状HBV感染、慢性乙型肝炎及HBV感染相关性肝硬化人群中分布频率彼此间存在显著差异(P均小于0.001);与慢性无症状HBV感染者相比(CC:46.5%;TG:32.9%;CG:15.9%),肝硬化人群中CC单倍型频率(35.3%)较低,CG(29.3%)与TG(34.0%)单倍型频率较高,其中CG单倍型频率升高更显著;与慢性无症状HBV感染者相比,慢性乙型肝炎人群中CC单倍型频率(37.2%)较低,TG(42.2%)与CG(18.9%)单倍型频率较高,其中TG单倍型频率升高更显著;与慢性乙型肝炎者(CC:37.2%;TG:42.2%;CG:18.9%)相比,肝硬化人群中CC(35.3%)与TG(34.0%)单倍型频率较低,而CG(29.3%)单倍型频率显著升高(CG比CC:x2=8.274,df=1,P=0.004;CG比TG:x2=15.027,df=1,P=0.000);两组人群间CC与TG单倍型频率相差不显著(x2=1.231,df=1,P=0.267)。慢性无症状HBV感染、慢乙肝、肝硬化三组人群彼此间各组基因型的频率也均存在非常显著差异(P=0.000);其中含CG单倍型的基因型(CG/CG,CG/CC和CG/TG)在肝硬化人群中频率最高(53.5%)。三、CⅡTA启动子Ⅳ不同单倍型DNA片段的功能研究包含CⅡTA启动子Ⅳ两SNP位点的片段(-1382~-913nt)插入pGL3-basic载体后转染HepG2的细胞萤光素酶表达量与pGL3-Basic转染HepG2后的细胞萤光素酶表达量之间无差异,提示CⅡTA-1350T/C和-944G/C位点所在的DNA片段(-1382~-913nt)无启动子活性。但pGL3-Promoter-CⅡTA-CC、pGL3-Promoter-CⅡTA-CG、pGL3-Promoter-CⅡTA-TC和pGL3-Promoter-CⅡTA-TG转染HepG2后的细胞萤光素酶表达量,均显著低于pGL3-Promoter转染HepG2后的细胞萤光素酶表达量,提示CⅡTA-1350T/C和-944G/C位点所在的DNA片段(-1382~-913nt)具有衰减子的功能。且四种单倍型间有显著差异,TG的萤光素酶活性(0.558±0.023)显著高于CG(0.464±0.016)、TC(0.463±0.015)、CC(0.302±0.016)单倍型。CG和TC单倍型高于CC单倍型(P=0.000),但CG和TC单倍型间活性无显著差异(P=0.892)。结论:1.CⅡTA启动子Ⅳ-1350C/T和-944G/C两个SNP位点所在的DNA片断(-1382~-913nt)无启动子活性,但具有衰减子的功能,-1350C/T和-944G/C位点多态性可影响CⅡTA启动子Ⅳ的活性。2.CⅡTA启动子Ⅳ的基因多态性与HBV感染的不同转归密切相关,其中活性最低的CC单倍型及CC/CC基因型与HBV感染的慢性化有关,活性最高的TG单倍型及TG/TG基因型与病毒的自限性清除有关,活性介于两者之间的CG单倍型及含CG单倍型的基因型(CG/CG,CG/CC和CG/TG)则与肝硬化的形成相关。
其他文献
<正>一、教学背景语文出版社《语文》教材九年级下册选用了《诗经》两首诗《关雎》和《蒹葭》,九年级的男女学生年龄说大不大,说小也不小,对于爱情已经有了朦胧的认识了,传纸
创作短篇是个知难而进的过程$$    刘庆邦(作家)$$    每次谈短篇小说都会想起沈从文先生1941年在西南联大所作的一个关于短篇小说的讲演,这个讲演我反复看过,他一开始
报纸
(一)目前全国各地一致重视了节约粮食的问题,对浪费粮食的行为进行了揭发。我们感到这是完全必要的。节约粮食有重大的意义;这可以从以下几方面来看: 一、从国家建设需要及
<正>1840年鸦片战争以后,我国进入一个新的历史时期,即习惯上所称的“近代”(1840年至1919年“五四”运动)和“现代”(“五四”运动以后)的时期。由于帝国主义列强的不断侵略,我国自
本文选取2008-2010年沪深A股上市公司为样本,在研究盈余管理与审计收费相关关系的基础上,借助内部控制进一步探讨了盈余管理对审计收费的影响在不同质量的内部控制环境下是否
苏州工业园区星湾学校通过对课程统整进行深入研究和校本实践,提出了课程统整的校本表达。在课程统整原有模式的基础上,开展了课程统整的实践创新、路径创新、教学管理的运行
面对2009年国际承包工程市场大幅萎缩的不利形势,KSB成功为迄今为止中印两国最大的电站合作项目提供电站用泵。国内最大的电力工程建设集团山东电建在年中成功签署了印度6&#21
建立了同时检测玉米面中5种农药残留量的高效液相分析方法。实验对样品前处理和色谱条件进行了研究和优化,5种农药在0.02~1.0μg.mL-1范围内具有良好的线性关系,相关系数为0.
美国上海商务中心不久前宣布正式开业。上海经贸界人士认为此举表明美国“新兴大市场战略”正式在中国推行实施。对此,我国决不可等闲视之。 美国上海商务中心是美国政府扩
期刊
背景CHB是一种难治性疾病,抗HBV是治疗CHB、改善患者预后的关键已成为共识。近十年来,抗病毒治疗的研究有了很大发展,尤以核苷类药物应用发展最快。其优点在于抑制病毒复制作