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本文运用1998-2007年全国工业企业微观数据，构造了资本、劳动配置扭曲指数及企业个体、总体扭曲指数，在此基础上实证分析了要素配置扭曲及其对企业全要素生产率（TFP）的影响，并检验了要素扭曲的主要来源。研究结果显示：（1）资本和劳动扭曲指数均大于0，且资本扭曲比劳动扭曲更为严重；（2）国有、集体企业的扭曲指数高于其他企业；（3）资本配置扭曲在样本时间内呈上升态势，劳动扭曲与总体扭曲指数波动较小；制造业扭曲程度高于其他行业；东部扭曲指数高于中西部地区。（4）如果企业能有效消除要素配置扭曲，则全部工业企业总体TFP有望提高25.56%，东、中、西部地区可分别提高27.34%、20.65%和27.21%。扭曲来源检验表明，资本劳动比、企业规模因素一定程度上恶化了资源配置扭曲，而外资、出口密度、补贴强度和企业年龄等能够缓解扭曲。