2005年7月21日,中国人民银行开始实行以市场供求为基础、参考一篮子货币进行有调节、有管理的浮动汇率制度,自此人民币汇率开始走上单边升值之路。伴随着汇率改革和人民币升值,我国的房地产市场也一路上涨至今,出现了举世公认的大泡沫；同时,我国的股票市场在2006-2007年也出现了十年未见的大牛市,直至07年底美国次贷危机爆发、引发全球金融海啸后,股票市场的泡沫才宣告破灭；而时至今日,创业板股票的平均市盈率仍领跑全球股市,很难说泡沫已完全消失。种种迹象表明我国房地产和股票市场出现的泡沫与人民币的升值有着极强的关系,这已被众多学者运用经济学的相关理论和实证检验过。但他们之间相互影响和作用的机制却众说纷纭,学术界也一直难以形成共识。众所周知,泡沫破灭对国家和经济带来的危害是巨大的。因此,研究人民币汇率与中国房地产和股市泡沫的相互作用机理和复杂关联性,对于目前尚处在结构调整、转型发展的中国具有重要的理论价值和现实意义。本文在研读并总结国内外学者研究成果的基础上,首先运用向量自回归模型,通过平稳性和协整检验、格兰杰因果检验、脉冲响应等方法分别对我国房地产市场、股票市场与人民币实际有效汇率、外国资本冲击之间的关系进行实证检验。通过运用上述计量经济学手段可以发现人民币汇率与房地产、股票市场之间存在着相互作用的正反馈性关系。同时我们也发现无论是从泡沫生成、演化、破灭的时间还是从泡沫的规模上讲,房地产泡沫与股市泡沫有着很大的不同；不同的市场、甚至股票市场中不同的行业板块都有它各自的特性和泡沫演化规律。另一方面,泡沫的形成、演化、破灭的变化趋势呈现出明显的非线性特性,具有一定的复杂性,无法通过传统经济学的均衡分析框架去理解和分析。本文通过引入系统工程的思想,将系统正反馈效应和PerBak的自组织临界性(SOC)理论运用到分析泡沫演化规律,可以很好地反映并解释人民币升值背景下房地产市场与股票市场泡沫不一样的演化规律。最后,运用JLS模型对不同市场的泡沫进行分析,从而得出JLS模型只能预测内生性的泡沫崩溃,而对外生性的泡沫破灭并不适用的结论；同时也论证了人民币升值是泡沫的内生性因素,因而可以预测出其泡沫系统的临界点,这对未来政府的决策具有参考和借鉴意义。