TXNDC9在胃癌中的表达及预后作用的研究

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yx_maomao
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目的:胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一。2020年我国胃癌新发病例数为47.9万,居我国恶性肿瘤发病的第2位,占全球胃癌新发病例数的43.9%;死亡例数为37.4万,位居我国恶性肿瘤死因的第3位,占全球胃癌死亡病例总数的48.6%。目前,我国胃癌筛查接受度低,患者首次诊断胃癌时多为进展期,预后通常较差。因此我国胃癌患者经手术和化疗后,5年生存率也仅为35.1%。因此,我国的胃癌总体疾病负担十分严峻。胃癌的发病机制复杂,患者预后差异较大,目前尚无有效预测胃癌患者长期生存的分子标志物。既往研究发现,硫氧化蛋白结构域蛋白9(thioredoxin domain-containing protein 9,TXNDC9)与结直肠癌、肝癌等消化道肿瘤的发生、发展、化疗耐药及预后相关,但各项研究间结论并不一致,提示TXNDC9在不同类型的恶性肿瘤、不同人群中的表达水平和作用可能存在差异。在胃癌方面,目前尚无大样本的队列研究和实验数据,探讨TXNDC9表达水平与胃癌发生和预后之间的关联。本研究利用公共数据库和胃癌随访队列,分析TXNDC9表达水平与胃癌发生和患者预后的关系,并利用生物信息学分析探究可能的分子作用机制,为探索TXNDC9能否成为预测胃癌发生和预后的分子标志物提供理论依据。方法:(1)基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中各类型恶性肿瘤的TXNDC9基因表达数据,其中胃癌部分包括375例胃癌患者肿瘤组织和其中32例研究对象的配对癌旁组织的表达数据,采用Mann-Whitney U检验比较胃癌及其他恶性肿瘤中在肿瘤组织和癌旁组织的TXNDC9表达是否存在差异。为探究TXNDC9与胃癌预后的关系,获取TCGA中350例、基因公共表达(gene expression omnibus,GEO)数据库中740例胃癌患者的癌组织TXNDC9表达数据和总生存期数据,采用Kaplan-Meier生存曲线和log-rank检验,分别分析两数据库中胃癌组织的TXNDC9表达水平与患者总生存期的关系。(2)q PCR法检测胃癌细胞系KATO-Ⅲ、AGS、MKN-45、MKN-74、HGC-27和正常胃上皮细胞系GES-1中TXNDC9的相对表达量,t检验比较在每一种胃癌细胞和正常细胞中TXNDC9的表达差异。(3)研究纳入2011年2月-2017年2月期间就诊于吉林大学第一医院,且组织学检查诊断为胃癌的患者233例构建胃癌队列。采集患者人口学资料、临床病理和诊疗信息;在患者术后第3、第6、第12个月以及之后每年进行电话随访,收集患者的术后化疗和存活状态等随访信息。研究对象的胃癌组织和配对癌旁组织深低温冻存标本和石蜡切块分别用于q PCR检测和免疫组织化学染色。根据免疫组化染色法检测的TXNDC9蛋白染色评分将所有研究对象分为TXNDC9高表达组和低表达组。应用χ~2检验或Fisher精确概率法分析TXNDC9蛋白表达与患者临床病理特征的相关性,Kaplan-Meier法绘制研究对象的生存曲线,log-rank检验比较不同TXNDC9表达水平的两组患者生存曲线的差异,多因素Cox回归分析胃癌预后的独立预测因素,并计算风险比(HR)及相应的95%置信区间(CI)。亚组分析评价各临床病理特征亚组TXNDC9表达水平与胃癌预后关系的一致性。(4)基于GEO数据集(n=740)的胃癌测序数据,应用Pearson线性相关系数衡量TXNDC9与各基因之间的相关程度,以r≤-0.27或r≥0.27且P<0.001为标准筛选与TXNDC9共表达的基因。对TXNDC9及其共表达基因集进行富集分析和蛋白互作网络(protein-protein interaction networks,PPI)构建,分析TXNDC9可能涉及的生物学过程、信号通路和蛋白间相互作用。结果:(1)TCGA数据库分析结果显示,TXNDC9在不同类型肿瘤中的表达特点不同,在肝癌、肺癌等10种肿瘤组织中,其表达水平高于相应的癌旁组织,但在肾嫌色细胞癌、肾透明细胞癌和黑色素瘤的肿瘤组织中,TXNDC9表达水平较低。对于胃癌,TXNDC9在肿瘤组织中的表达量高于癌旁组织(P<0.001),提示TXNDC9可能与胃癌的发生相关。生存分析发现,不同来源的数据中胃癌肿瘤组织TXNDC9表达与患者预后的关系不一。TCGA数据库来源的350例胃癌患者中,TXNDC9高表达患者的中位生存时间更短(20.6月vs.43.1月,log-rank P=0.006),死亡风险更高(HR=1.58,95%CI:1.14-2.20)。但GEO数据集来源的740例胃癌患者中,TXNDC9高表达患者的中位生存时间反而更长(70.2月vs.26.6月,log-rank P<0.001),死亡风险更低(HR=0.62,95%CI:0.50-0.76),提示TXNDC9表达可能与胃癌的预后相关,但结果不一尚需进一步研究。(2)在细胞水平上,各种胃癌细胞系中TXNDC9 m RNA的表达量均呈现低于胃正常粘膜上皮细胞系的趋势,但差异无统计学意义(P值均大于0.05)。(3)本研究的原始队列研究共纳入了233例研究对象。39例研究对象检测了冻存组织的TXNDC9 m RNA表达量,结果显示,胃癌组织中TXNDC9表达量低于癌旁组织(P=0.047)。233例研究对象的组织免疫组化染色结果显示,相比于配对癌旁组织,胃癌组织的TXNDC9蛋白高表达率较低,但差异无统计学意义(P=0.433)。在233例胃癌患者总人群中,未发现TXNDC9蛋白表达水平与临床病理特征相关。生存分析结果显示,相比于低表达组(30.7月),TXNDC9高表达的研究对象中位生存时间更长(89.4月,log-rank P=0.001),预后更好(HR=0.56,95%CI:0.38-0.80)。多因素Cox回归结果显示,TXNDC9蛋白高表达、TNM分期较早、无神经束膜浸润、肿瘤不足5cm以及接受术后化疗与胃癌患者的总生存期延长相关。调整其他潜在预后因素的影响后,TXNDC9蛋白高表达的胃癌患者死亡风险降低42%,是胃癌患者预后的独立预测因素(HR=0.58,95%CI:0.40-0.85)。亚组分析也显示,TXNDC9蛋白高表达的患者术后总生存期更长的趋势在各个亚组较为一致。(4)GEO数据集筛选得到与TXNDC9共表达的基因174个。富集分析显示,共表达基因集中在细胞周期、ATP酶活性、错配修复、剪接体等生物学功能或通路上。蛋白互作网络显示,TXNDC9与细胞周期相关蛋白AKT1、PDCD10、CDK1、p53等可能存在调控关系。结论:(1)在中国胃癌人群中,胃癌组织中TXNDC9的m RNA和蛋白表达水平低于癌旁组织,TXNDC9可能与胃癌的发生相关。(2)TXNDC9蛋白表达是胃癌患者预后的独立预测因素,TXNDC9高表达的患者中位生存时间更长,预后更好。(3)除TXNDC9表达外,TNM分期、神经束膜浸润、肿瘤直径以及术后化疗也是胃癌预后的独立影响因素。(4)TXNDC9蛋白可能发挥诱导细胞周期阻滞、抑制PI3K/AKT信号通路等作用。
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