近年来,企业内部控制制度缺陷一直是研究的热点问题。安然、世通等国外企业以及中航油等国内公司破产或项目巨额亏损的发生，已经明显的显示出企业内部控制亟需完善。为重塑公众对上市公司的信心，为了更好地对企业内部控制进行严格的监督和管理，世界各国政府陆续颁布了相关的法律规范，主要有《SOX法案》《金融工具与交易法》《企业内部控制基本规范》及其配套指引。对于企业来说,内部控制的主要作用就是对财务报表的可靠性提供有力保障。目前国内外制定的涉及内部控制体系和风险监控机制的法律法规很少，各项条例还不够完善，这使得企业出现财务舞弊案件不断发生。因此正确的认定企业内部控制缺陷所处于的类型以及了解企业管理层出于何种心态来处理所认定的缺陷是首要面对的难题。本文参考了国内外学者在内部控制缺陷认定中的研究成果，对企业内部控制缺陷认定进行理论解读以便更好地获得研究思路。从COSO法案和内部控制五要素中了解到公司内部控制缺陷和内部控制的五要素有着紧密的联系，内部控制五要素主要包括控制环境、风险评估、控制活动、信息与沟通和监控；以内部控制五要素、委托代理理论以及信息不对称理论为基本的着眼点来进行内控缺陷认定研究。首先介绍了内部控制以及内部控制缺陷的概念、局限性和理论基础，以便在下列的研究中有足够的理论做支撑。然后深入的剖析了我国企业内部控制缺陷认定方面的现状，按不同的情形进行分类划分，分析导致我国企业内部控制缺陷认定不规范的原因。通过对其他研究者得出的成果进行创造性的改进，基于我国内部控制缺陷的认定来制定一套财务报告和非财务报告内部控制缺陷认定流程，对企业产生的内部控制缺陷首先进行单个的认定，之后再汇总组合认定，得出准确地认定结果。案例中通过对A上市公司的概况进行简单介绍，分析影响企业财务报告的应收账款以及应付职工薪酬，发现应收账款在运行的过程中未能严格按照规定执行，出现提高信用额度和多头授信的情况。应付工资环节中未能准确的核对企业当期的应付工资计算表以及员工人数变动表等必要进行的程序。通过对企业内控缺陷认定流程来分析企业内控缺陷对财务报表的影响程度，首先从单一的缺陷角度来分析应收账款和应付工资问题对企业当期财务报表的影响程度，将认定方式流程化和规范化，以求认定结果更加准确。最后再对多种缺陷组合进行评定，结合其他可能涉及到的影响因素来最终评定其所处的缺陷类别。这样的认定方式可以更加直观和准确的体现出问题出现的类型，也更好的看出在认定过程中有哪些是容易忽视的环节。本文的研究为我国内部控制缺陷认定的完善提供了参考价值。最终根据本文的研究思路和方法可以得出:上市公司的内控制度就是要确保内部控制得到可靠有序的运营，一旦在运营过程中发生内部控制缺陷，则必须采取及时有效的措施来改正，以保证企业内控的良好运行和将损失降到最低，使企业的内控体系设计和运行更加完美。同时，我国政府监督和管理部门应当制定相关的法律规范来对内控缺陷的认定进行强制要求，使以后企业内控缺陷认定的可信度和准确度都得到提高，有助于信息的使用者更好的了解企业运营情况。