产前先天性心脏病胎儿的全基因组基因拷贝数变异分析

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目的:先天性心脏病(CHDs)是指出生前由于各种原因导致的心脏、血管结构和功能上的异常疾病,是围产期胎儿死亡的主要原因,约10%的孕妇因此病而流产。2012年我国卫生部发布了《中国出生缺陷防治报告》,其中提到CHDs患者占我国出生缺陷人口的27.6%,为发病率最高的出生缺陷性疾病。CHDs的发生与环境因素和遗传因素都有关。遗传因素方面,至今仅明确55个基因为CHDs的致病基因,仍有相当一部分基因与CHDs的相关性有待进一步的探究。近五年,人们对于心脏发育分子通路的研究越发深入,多个研究证实,基因拷贝数变异(CNV)通过影响基因的剂量水平或功能改变,与CHDs密切相关。全基因组微阵列技术(CMA)的应用与推广,特别是单核苷酸多态性微阵列技术(SNP array),正是针对检测CNV发展起来的一项分子检测技术。应用该技术研究CHDs可以发现大量与CHDs相关的CNV,进一步挖掘基因剂量与CHDs的关系,从而拓展我们对CHDs发生的分子机制认识,并发现可能与CHDs发生相关的致病基因。本研究同时比较了各种分子生物学技术,特别是SNP array与传统核型分析技术,在遗传病因学检测方面的优劣势,通过探究致病性或潜在致病性CNV与CHDs的相关性,评估SNP array等分子生物学技术诊断CHDs的临床应用价值。  方法:对44例经超声心动图确诊为CHDs,但无法明确病因的胎儿进行遗传病因学分析。在超声引导下,穿刺采集CHDs胎儿的羊水和脐带血样本,对所得样本行核型分析和SNP array检测。根据2011年美国医学遗传学委员会制定的CNV致病性判断标准进行CNV分类,将检测所得到数据导入多个CNV数据库进行比对分析,同时结合实时荧光定量PCR和多重连接探针扩增技术(MPLA)对罕见CNV进行验证及父母溯源分析。通过以上传统细胞遗传学技术与分子生物学相结合的检测策略着重对CHDs胎儿的染色体畸变与全基因组CNV进行检测和分析。  结果:总共收集经超声心动图确诊为CHDs胎儿样本44例。核型分析发现异常核型5例,异常检出率约为11.4%。排除核型分析异常的样本,应用SNP array检测其余39例CHDs胎儿,在38例胎儿中检出CNV,CNV覆盖率约为97.4%,其中7(17.9%)例胎儿携带有异常CNV,包括致病性CNV携带者4例和可能致病性CNV携带者3例;2(5.1%)例胎儿携带有不确定的CNV,其余胎儿均携带良性或可能良性CNV。我们检出的7例携带异常CNV的胎儿中,3例胎儿携带的罕见CNV未在其他CHDs与CNV研究中被报道过,分别为16q12.2微缺失,Xp11.4微重复和Xq28微重复,其中分别包含了三个与心血管发育相关的候选基因:RBL2(16q12.2)、BCOR(Xp11.4)、FLNA(Xq28)。  结论:应用SNP array技术检测CHDs胎儿携带的异常CNV并深入探讨CNV与CHDs之间的关系,发现了三个可能与心脏发育或结构功能相关的基因。本研究结果对CHDs相关的关键基因的定位以及CNV致病机理的研究都有非常大的推动作用。同时,本研究对4例CHDs胎儿的遗传学病因进行明确诊断,为CHDs的遗传咨询和产前诊断提供可靠依据,成功预防了CHDs患儿的出生。
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