杨梅果实色泽和花青苷含量在品种间存在显著的差异，如‘水晶’杨梅不含或几乎不含花青苷，‘东魁’花青苷含量适中，而‘荸荠’花青苷含最较高，使得三品种分别呈现乳黄、红色和紫黑色。但三品种间花青苷差异积累的原因尚无研究。因此，本文以此3个品种果实为试验材料，分离了花青苷合成途径上的所有基因以及调节基因MYB，设计了实时PCR引物并加以验证，应用实时荧光定量PCR技术分析了基因表达的丰度。研究结果表明，CHS和CHI表达与品种间花青苷含量的差异关系较小，可能不是花青苷合成的限速因子；合成途径上的其他基因均在一定程度上与花青苷合成相关，尤其是UFGT和F3H可能是花青苷合成的限速位点。因此，该三个不同色泽杨梅品种间果实花青苷积累的差异是多个基因差异表达协同作用的结果，但不同基因的重要性有所不同，以UFGT和F3H较为关键。