Identification of a nucleus degradation inhibitor I and related gene network in plant male gametogen

来源 :2012作物杂种优势利用国际学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zyhui1984
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通过 8118个注释重构的豆状带绦虫(Taenia pisiformis)成虫转录组序列,首次分析了豆状带绦虫同义密码子的使用情况.重构基因的平均GC含量为49.48%.32个密码子被认定为豆状带绦虫的偏好密码子,其中有17个偏好密码子以G或C结尾.基因在第一主轴上的位置与基因的GC含量及密码子第三位GC含量显著正相关.提示核酸组成是形成豆状带绦虫密码子偏好的主要原因,同时编码蛋白的亲水性及芳香性
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背景 microRNA 被公认为在动植物转录后基因调节中,调节生长、发育、行为和应激起到相当重要的作用.由多头带绦虫幼虫阶段引起的人畜共患寄生虫病脑多头蚴病分布全球各地,特别是非洲和东南亚地区的发展中国家,给牧场带来重大经济损失,影响人类健康.为了进一步了解作为感染源的多头带绦虫的生态适应的miRNA 的作用寻找控制该绦虫的方法,对其进行大规模的miRNA 鉴定是必要的.
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背景 多头带绦虫是一种全球性的绦虫,其幼虫阶段寄生在羊和其他家畜的中枢神经系统,通常导致死亡和巨大的社会经济损失,特别是发展中国家.该寄生虫也能导致人的感染,但是由于诊断技术和研究的缺乏而被忽略.第二代测序技术的最新发展为探索多头带绦虫的转录组提供了机会.方法/发现 我们利用Illumina 成对测序技术和新的Trinity 组装软件得到了31,282 个unigenes(平均长度920bp).
会议
背景 犬恶丝虫可引起犬、猫的心肺犬恶丝虫病,同时还能感染多种野生哺乳动物以及人类.目前,对犬恶丝虫预防和治疗的根本策略的研究受限于缺乏对该病原体基本分子生物学特性的认识.方法和主要发现 综合运用第二代测序平台、高效率的De novo 短序列组装软件以及系统的生物信息学分析,我们揭示了犬恶丝虫成虫转录组的总体情况.经过去污染后我们得到了约2230 万个干净的原始序列,并通过组装得到了20,810 个
会议
细菌以游离或固着状态存在,其中固着状态是指包裹于一种自身产生的被称为生物膜(Biofilm)的含水聚合物基质中.临床应用上,抗生素的应用只能通过杀死游离状态的细菌从而缓解某些病症,而生物膜的存在则会使多数抗生素药物无法直接穿透生物膜从而对细菌本身造成有效的杀菌效果.抗生素可以通过杀死游离状态的致病菌在一定程度上消除病症,停药后如果菌膜成熟后并开始将病菌向其它组织分散,从而导致更广泛的病灶产生直至宿
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