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为应用RDF分子理论，在MapReduce框架下设计了面向分布式语义级电子政务的查询和推理算法。通过对大规模RDF文件的分解，将RDF图无损分解为若干RDF分子，再利用相应的map和reduce程序在各分布结点对RDF分子文件进行语义查询，查询结果经RDF分子合并算法处理后形成全局查询和推理结果。利用云计算相关技术，提供了面向超大规模数据集的分布式处理机制，对当前拥有海量数据的电子政务的语义处理能力和存储能力有较好的提速作用。