【摘 要】
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In this study, single nucleotide polymorphisms (SNPs) were screened from 454 high-throughput sequencing library oftranscriptomeof Scylla paramamosain.Putative SNPs were first identified by the compari
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In this study, single nucleotide polymorphisms (SNPs) were screened from 454 high-throughput sequencing library oftranscriptomeof Scylla paramamosain.Putative SNPs were first identified by the comparison of multiple homogeneous sequences, and then genotyped by Tm-shift primers using StepOnePlus Real-time PCR System.A total of thirty-eight SNPs were confirmed, with five types of base substitutions including A/T transversion, G/C ransversion, A/C transversion, C/T transition and A/G transition, of which C/T was the most common variation observed.This study provided new molecular markers for genetic background and population genetic diversity research, and will be useful for construction of genetic linkage map of the mud crab Scylla paramamosain.
其他文献
本研究旨在探讨凡纳滨对虾对色氨酸的需要量.以鱼粉和豆粕作为完整蛋白源，添加晶体氨基酸配制6种等氮等脂的实验饲料(粗蛋白含量为41.0％、粗脂肪7.8％)，饲料中的L-色氨酸水平从0.2％以0.06的梯度逐步上升到0.5％.实验每组设3个重复，每个重复40尾虾(初始体重为0.31 g±0.00 g)，每天饲喂4次，实验为期7周.结果表明：饲料中色氨酸为0.32％组的增重率、特定生长率和蛋白质效率最高
以手挤一镊取雄虾的精荚、低温木屑干运过程死亡雌虾的精荚、经生殖活动后蜕壳雌虾的精荚和蜕壳雌虾为实验材料,通过伊红苯胺黑染色、细胞计数的方法和精子的数量、畸形率和存活率为指标评价精荚质量,采用不同来源、不同保存时间的精荚和不同处理方式(自然产卵法、湿法、滴管法和干法授精)进行日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)的体外人工授精实验.实验结果表明：刚死亡雌虾精荚内精子数量为1.45
游离氨基酸在甲壳动物渗透压和细胞容积调节过程中起非常重要的作用,相关的分子机制尚没有得到系统论证.本实验利用新一代的转录组测序技术(RNA-seq),以淡水条件下中华绒螯蟹为对照,研究了急性盐度胁迫(30‰)24h后对其相关基因表达情况.研究共获得2.769亿条序列(Read),经组装获得20.637万个克隆重叠群,平均长度为613.9bp,N50值为1,470bp.采用CLC Genomics
凡纳滨对虾的淡化养殖在世界范围内得到了飞速发展，当前已经成为我国内陆低盐度对虾养殖的一个亮点和重要的组成部分。渗透压的调节是一个高耗能的过程，是凡纳滨对虾内陆养殖面临的首要问题。所以，糖代谢必然参与其中，并可能起着重要的作用。
脊尾白虾是我国重要的经济养殖种类,具有生殖周期短,可实现在实验室全年养殖等特点,被认为是开展虾类发育和免疫研究的较好的动物模型,但目前仍缺少对其分子遗传学基础方面的研究。为对脊尾白虾遗传学的分子基础进行深入了解,本实验利用新一代测序技术(ROCHE454)对脊尾白虾胚胎发育不同时期以及成虾应对各种病原刺激的转录组进行了测序、拼接和注释,并对胚胎的基因表达与成虾进行了比较,以挖掘与胚胎发育或免疫相关
C型凝集素作为模式识别受体(pattern recognition receptor,PRR),参与了宿主对病原的识别过程并进而启动宿主的免疫反应.本研究克隆得到2种新型的中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)C型凝集素基因(分别命名为FcAV和FcLec),分析了它们的分子结构特征,并对二者的组织分布及应答不同病原感染的表达变化模式进行了研究.FcAV基因开放阅读框(OR
凡纳滨对虾(litopenaus vannamei)的选择育种工作已经开展十余年，通过人工选择，可以实现优良性状的富集，培育出具有生长优势或者抗性性状的新品种。由于通过外部体征很难将选育得到的新品种与其他凡纳滨对虾区分开来，因此亟需建立一种对累代选育新品种进行鉴定的技术。本文以实验室累代选育获得的凡纳滨对虾"科海1号"新品种作为实验对象，选取目前国内养殖的具有代表性的市场品种"正大"虾苗、"通威"
拟穴青蟹是广泛分布于中国东南沿海的重要经济物种.雌雄个体生物学性状和经济性状的不同使我们对造成性腺差异的分子调控机制更为关注.本研究应用下一代高通量测序技术454 GS FLX对青蟹精巢和卵巢进行大规模转录组测序,共获得3651 16条ESTs(平均长度为285.4bp).通过聚类拼接,共产生44605条独特转录子,其中21791条isotigs和22814条singlets.与Nr蛋白数据库进行
为获知丝氨酸蛋白酶同源物(serine proteinase homolog,SPH)在日本沼虾免疫防御中的作用,本研究采用RACE技术,克隆了日本沼虾具有clip结构域的丝氨酸蛋白酶同源物(MnSPH),并用实时定量PCR技术观察了其表达特性.结果表明,该基因全长1897bp,开放阅读框长1701bp,编码由566个氨基酸组成的蛋白,基因两翼分别存在103 bp(5端)和93bp(3端)的非翻译
眼柄是甲壳动物重要的内分泌器官,其XO-SG复合体在甲壳动物生长发育、蜕皮及生殖等过程中发挥关键作用.本研究采用454-FLX高通量测序技术对拟穴青蟹(Scylla paramamosain)雌雄眼柄XO-SG复合体的cDNA文库进行大规模测序,旨在阐明性腺发育调控网络的分子机制.我们分别在青蟹雌雄眼柄的XO-SG复合体中获得124515(雌)和142892(雄)高质量的reads,使用Newbl