【摘 要】
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眼柄是甲壳动物重要的内分泌器官,其XO-SG复合体在甲壳动物生长发育、蜕皮及生殖等过程中发挥关键作用.本研究采用454-FLX高通量测序技术对拟穴青蟹(Scylla paramamosain)雌雄眼柄XO-SG复合体的cDNA文库进行大规模测序,旨在阐明性腺发育调控网络的分子机制.我们分别在青蟹雌雄眼柄的XO-SG复合体中获得124515(雌)和142892(雄)高质量的reads,使用Newbl
【机 构】
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集美大学水产学院 厦门 中国361021 西东大学生物系 新泽西州 美国07079
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眼柄是甲壳动物重要的内分泌器官,其XO-SG复合体在甲壳动物生长发育、蜕皮及生殖等过程中发挥关键作用.本研究采用454-FLX高通量测序技术对拟穴青蟹(Scylla paramamosain)雌雄眼柄XO-SG复合体的cDNA文库进行大规模测序,旨在阐明性腺发育调控网络的分子机制.我们分别在青蟹雌雄眼柄的XO-SG复合体中获得124515(雌)和142892(雄)高质量的reads,使用Newbler(版本2.5.3)拼接后得到17693(雌)和29467(雄)条独特转录子(unique transcripts).将获得的独特转录子与NCBI的非冗余数据库比对,分别有741(雌,4.19％)和1351(雄,4.58％)条被注释.Gene Ontology (GO)分析显示来自雌雄拟穴青蟹眼柄XO-SG复合体的cDNA文库的387 (52.23％)和687 (50.85％)条独特转录子各获得1850与31 17条GO注释,其中雌雄各有570和939条独特转录子参与新陈代谢和细胞功能.KEGG分析表明,注释的独特转录子主要参与新陈代谢、氧化磷酸化和次级代谢产物的生物合成.根据独特转录子的RPKM值,鉴定出雌雄眼柄特异表达的转录子分别有9897个和21691个.通过Fisher精确检验(Fisher,P＜0.05)发现雌雄眼柄差异表达的独特转录子3182个,其中942个在雌眼柄高表达,2240个在雄眼柄高表达.对部分雌雄差异表达(23个)和特异表达(雌25个,雄27个)的未知独特转录子(没有注释信息)的实时荧光定量结果显示,雄性眼柄XO-SG复合体中有14个高表达和3个特异表达,雌性有5个高表达和3个特异表达.这些结果为探索眼柄在性腺发育调控网络中的作用奠定了基础,同时我们也建立了拟穴青蟹雌雄眼柄的EST数据库,为进一步的相关研究提供基础的参考数据.
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