鸡IGFBP2基因1196CA单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析

来源 :遗传学与表观遗传学前沿暨第三届中国青年遗传学家论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:iamphfeng
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  鸡IGFBP2基因1196C>A单核苷酸多态性(SNP)与肉鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.该SNP位于IGFBP2基因3 ′非编码区(3 ′UTR),生物信息学分析显示,该位点恰好位于gga-miR-456-3p的一个潜在靶基因结合区,提示该SNP位点可能是功能性SNP,它可能影响gga-miR-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用.为确认该SNP是否为功能性SNP,本研究分别构建了该SNP位点C和A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析了这两个等位基因在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;并利用miRNA mimics和inhibitor分析了gga-miR-456-3p对内源性IGFBP2的表达调控作用.结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性均显著高于C等位基因(P<0.05).进一步的实验证实,gga-miR-456-3p调控IGFBP2基因的表达,且SNP(1196C>A)影响gga-miR-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用.本研究证实IGFBP2基因是gga-miR-456-3p的一个靶基因,而且其3 ′UTR区的1196C>A是一个功能性SNP.本研究对于鸡的分子辅助选择育种以及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义.
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