论文部分内容阅读
诱导多能干细胞(iPS)，源自体细胞的重编程，在临床医学上有巨大的潜在应用价值.然而值得注意的是最新研究表明体细胞重编程形成诱导iPS的过程中会诱导基因组拷贝数变异(CNV)形成.而CNV是人类疾病非常重要的一个致病因素.目前还不清楚基因组的不稳定是否与重编程方法和/或者供体细胞的遗传背景相关.另外，全基因CNV分析在技术上存在缺陷，所得CNV数据需要谨慎分析.为了研究体细胞重编程过程中可能的CNV不稳定，我们对来自同一供体细胞41例小鼠iPSCs进行全基因组分析.同一供体细胞的应用可以排除供体细胞遗传背景对iPS细胞基因组完整性的影响.不同组合和不同剂量的重编程因子的使用被用于研究诱导方法对iPS基因组完整性的影响.应用高分辨率的比较基因组杂交技术在41例iPSCs中共检测到63个CNVs.有趣的是，研究发现CNV数目与经典重编程因子的剂量呈负相关.而且，相比于经典重编程因子，使用高效工程因子诱导的iPS检测到更少的CNVs.我们研究认为重编程过程中，充分的重编程动力可以保护iPS细胞基因组的完整性.