【摘 要】
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织锦巴非蛤是一种重要的海水养殖贝类.广泛分布于中国、菲律宾和马来西亚.目前,关于织锦巴非蛤的研究主要集中在人工养殖和营养分析方面,而转录组和基因组的研究几乎没有
【机 构】
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集美大学水产学院,农业部东海海水健康养殖重点实验室,福建厦门361021
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织锦巴非蛤是一种重要的海水养殖贝类.广泛分布于中国、菲律宾和马来西亚.目前,关于织锦巴非蛤的研究主要集中在人工养殖和营养分析方面,而转录组和基因组的研究几乎没有报导.本研究对织锦巴非蛤斧足组织进行了转录组分析,通过测序,总计得到20219795 个Reads,包含了4.08 Gb 数据信息.经序列拼接与组装,获得54852 条Unigene 序列,N50 的长度达到829 bp.将所有的Unigene 与公共数据库中的基因进行同源比对,38.92％的序列成功的注释到 Nr、Nt、Swiss-Prot、GO、COG、KEGG 等7 个数据库中.其中,14571 条序列注释到GO 数据库,5448 条序列注释到COG 数据库,6738 条序列注释到KEGG 数据库中的228 条代谢通路上.对转录组序列进行微卫星标记的发掘,预测到5606 个候选的位点,随机选择80 个位点进行引物设计,用一个野生群体来扩增进行多态性验证,结果发现 36 个位点显示多态性.本研究中得到的转录组数据和开发的微卫星标记,将为织锦巴非蛤后续的功能基因分析、遗传图谱构建和QTL 定位提供参考.
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