限制性片段长度多态性结合微流控芯片电泳检测大肠癌K-ras基因点突变

来源 :中华医学会医学细胞生物学分会第三届全国学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Melanzpl2
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的 K-ras基因点突变发生于早期腺瘤向中期腺瘤的转变阶段,可能是大肠癌恶变的始动基因.微流控芯片技术是近年迅速发展起来的新的微型分析系统,具有微型化、自动化、集成化及便携化的特点.本研究以K-ras基因点突变作为检测对象,将限制性片段长度多态性(RFLP)与微流控芯片相结合,建立将样品进样、分离、检测和记录等步骤连续自动处理的基因突变检测平台.方法 PCR扩增含有K-ras基因第一外显子的第12位密码子的片段,并进行Mva Ⅰ酶切,酶切产物以微流控电泳系统进行检测.采用光刻及高温封接技术制作通道为十字交叉形的玻璃微流控芯片,结合激光诱导荧光检测系统,建立微流控毛细管电泳技术平台.采用该平台对6种已知突变类型的大肠癌细胞系及98例大肠癌石蜡包埋组织中的K-ras基因突变进行检测.同时将大肠癌K-ras基因野生型细胞株HT29和纯合突变细胞株SW480以不同比例混合,研究系统的检测灵敏度.结果 RFLP结合微流控芯片电泳平台可在5 min内实现对K-ras基因的高效检测,6种大肠癌细胞系中K-ras基因的纯合突变、杂合突变及野生型均被准确检出.对不同比例野生型/纯合突变型混合细胞的检测显示系统的检测灵敏度可达1/10 000.该系统对98例石蜡包埋组织标本中K-ras的突变检出率为28.6%(28/98),显著高于测序的检出率13.3%(13/98).结论 本研究建立的RFLP结合微流控芯片电泳平台能够对K-ras基因突变进行高效检测,具有灵敏度高、特异性强、快速和低成本等优势,为快速进行肿瘤基因突变筛查及早期诊断提供了新的技术平台.
其他文献
目的 肝细胞肝癌中细胞的异常增殖和细胞周期紊乱常常伴随着p16INK4a基因的沉默。近年来,随着对肿瘤研究的深入,人们发现DNA序列以外的表观遗传学调控机制异常在肝癌的形成和发展过程中起着重要的作用。本研究对肝癌发生发展过程中的p16INK4a表观遗传学改变进行探讨,不但可以对肝癌的发病机制有新的认识,而且还可从中筛选出敏感特异的肝癌分子标志物以及用于治疗的靶分子。方法 建立了小鼠胚胎干细胞和肿瘤
目的 探讨不同参数发光二极管(LED)重复照射对成纤维细胞生长的影响.方法 采用不同波长(红光630 nm、绿光530 nm和蓝光470 nm)及不同能量密度(37.5 mW/cm2,0、2.25、6.75、13.50、20.25和33.75 J/cm2)LED重复照射(1次/d,连续照射3d)体外培养的大鼠肺成纤维细胞.采用MTT法检测细胞抑制率,Hoechst 33342荧光染色观察细胞核凋亡
目的 肿瘤起始细胞(或称为肿瘤干细胞)的存在被认为是肿瘤复发转移、耐受常规治疗的根本原因.对于这类细胞的分离鉴定和研发针对性的治疗用生物技术类药物是肿瘤学研究领域亟待解决的关键科学问题.本研究对离子通道蛋白X是肝癌肿瘤起始细胞的标志物和治疗分子靶点进行探讨.方法 我们从同一肝细胞癌病人的原发和复发灶的标本中分别培养出细胞系Hep-11(原发肝癌组织来源)和Hep-12(复发肝癌组织来源).利用群体
目的 探讨青藤碱(SN)体外抑制人肝癌细胞HepG2生长及诱导其凋亡的作用机制.方法 (1)采用形态学观察青藤碱处理前后细胞的形态学变化;(2)MTT和SRB法检测青藤碱对人肝癌细胞HepG2的生长抑制作用;(3)流式细胞术分析了细胞周期分布;(4)Hoechst染色和流式细胞术分析青藤碱对细胞的凋亡作用;(5) RT-PCR方法检测survivin在mRNA水平的表达;(6)Western bl
探讨小分子化合物靶向IAP家族增强放疗敏感性策略的可行性及机制,为解决头颈部鳞状上皮肿瘤(HNSCC)放疗耐受提供思路。研究应用IAPs拮抗分子-Smac的小分子类似物SM-164,在5种细胞株和1种裸鼠移植瘤上考察其是否可增强放疗敏感性、是否具有肿瘤选择性,并探讨其增敏机制。该类小分子化合物已被报道在部分肿瘤中具有化疗增敏疗效,同时该类小分子也成为发现cIAP-1作为E3泛素连接酶底物的重要工具
氧化应激是一种普遍存在的对细胞稳态的改变,主要由细胞内产生的多余活性氧引起。通常细胞根据不同氧化应激水平对基因表达谱整体改变和蛋白翻译后修饰进行差异性调整以适应各种变化。研究发现:低氧或常氧下轻度氧化应激可使HIF-1α稳定并增强HIF-1活性;重度氧化应激下,HIF-1活性又可被抑制。然而活性氧调控HIF-1活性双相变化的机制并未阐明。
幽门螺杆菌阳性胃炎与胃癌的密切关系早已得到公认,但其致癌机理目前并不清楚。我们最近的初步研究提示,幽门螺杆菌感染引起的长期的、轻度的氧化应激导致的蛋白质修饰的改变可能在胃炎到胃癌的发生过程中起到重要促进作用,而SUMO特异蛋白酶SENP3可能参与介导这一作用。我们在人胃癌和胃炎组织中发现:幽门螺杆菌(Hp)感染的胃炎组织与无Hp感染的胃炎组织相比,间质中巨噬细胞大量增加,部分巨噬细胞中SENP3增
目的 皮肤癌为表皮角质形成细胞的恶性增生,皮肤恶性肿瘤的发病率逐年递增,因此研究皮肤癌发生发展的分子生物学机制对于预防及选择合理的治疗策略具有重要意义.方法 91例皮肤癌及癌前病变组织,皮肤鳞癌细胞系colo16.采用石蜡组织微阵列技术,运用免疫组织化学染色,RT-PCR,Western-blot和FCM等方法检测91例皮肤癌及癌前病变组织中Wnt、Notch、NF-kB和Stat3等信号通路的活
Nucleophosmin(NPM)是一种核仁磷酸化蛋白,在细胞增殖和生长中发挥重要作用,但它对细胞增殖分化的作用机制及其在细胞内的定位和转运尚不清楚。本研究应用核基质蛋白选择性抽提亚细胞蛋白质组学技术研究人成骨肉瘤细胞、人肝癌、胃癌和入神经母细胞瘤细胞诱导分化过程中核基质蛋白的表达变化。结果发现NPM存在于细胞核基质组分中,并在不同诱导分化物诱导同一种肿瘤细胞分化和同一种诱导分化物诱导不同肿瘤细
胃癌是全世界范围内引起死亡的重要因素之一,P21活化蛋白激酶(PAKs)作为肿瘤细胞信号网络中的关键调节因子,通过其广泛存在的下游结合蛋白或激酶底物在胃癌进程中发挥重要作用.近些年来人们针对PAKs结构特点及活化方式设计并合成了一些PAK抑制分子,但特异性仍有待于改善.PAK家族共有6个成员,结构上均包含有N末端的调节域和C末端的激酶域,根据结构特点和活化方式及生物学功能的不同可分为两类:Ⅰ类包括