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本文基于AFC数据分析客流特点，从乘客角度出发，提出了一个双层规划模型来描述列车运行调度方法及其可靠度控制的问题。在双层规划模型中，上层模型为一个基于乘客出行时间可靠度的列车调度模型，下层模型是一个成本最小的控制发车优化模型。针对所提出的模型，设计了基于遗传算法的求解算法，并给出了实例来验证模型及算法。