利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估

来源 :中国生物工程学会2014年学术年会暨全国生物技术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xtt1027
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  流行病学研究表明H7N9禽流感病毒的传播和活禽贸易之间存在关联。应用大数据技术分析活禽交易的网络数据,可获得活禽贸易信息,进而进行疫情溯源并预测未来传播趋势。为对大数据预测得到的H7N9传播模型进行评价,从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,使用RAxML软件构建了系统进化树推断2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市间的传播情况,并与大数据推断结果进行了对比分析。结果表明,系统进化树推断结果更为准确,但大数据分析能够提供更多地区的信息且具有更好的时效性,同时推断的传播模型准确度较高,在H7N9疫情的应对中具有较高的应用价值。
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