【摘 要】
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本研究利用PCR以及3和5RCAE技术获得黄嘴白鹭MHC Ⅱ类B基因全长1020bp的cDNA序列和全长2360bp的DNA序列.实验中共分离得到4个位点的MHCⅡ类B功能基因序列,分别命名为Egeu-DAB
【机 构】
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厦门大学滨海湿地生态系统教育部重点实验室,厦门 361102
【出 处】
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第十二届全国鸟类学术研讨会暨第十届海峡两岸鸟类学术研讨会
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本研究利用PCR以及3和5RCAE技术获得黄嘴白鹭MHC Ⅱ类B基因全长1020bp的cDNA序列和全长2360bp的DNA序列.实验中共分离得到4个位点的MHCⅡ类B功能基因序列,分别命名为Egeu-DAB1-4.黄嘴白鹭MHC Ⅱ类B基因DNA序列包含6个外显子和5个内含子.其中外显子1为91bp编码前导肽,内含子1长度280～600bp,外显子2长270bp编码β1区域,内含子2长度为266bp,外显子3长282bp编码β2序列,内含子3为11obp,外显子4编码跨膜区长107bp,内含子4为115bp,外显子5编码部分胞质结构域,内含子5为160bp,外显子6编码胞质结构域和部分3UTR.不同位点间序列差异集中出现在第一内含子部分.利用2010年福建菜屿繁殖黄嘴白鹭种群的32个幼鸟个体检测MHCⅡ B基因第二及第三外显子的多态性,共获得包含第二外显子和第三外显子,长度为1470bp的的22个单倍型序列.这些序列中9个来自Egeu-DAB1位点,5个来自Egeu-DAB2位点,3个来自Egeu-DAB3位点,剩余5个来自Egeu-DAB4位点.在外显子部分多态性最高的是Egeu-DAB1位点,同时该位点的dN/ds值为1.87表现出正选择作用,多态性最低的是Egeu-DAB3位点.采用PAML软件中的CODEML程序计算第二外显子上的正选择作用,共发现了13个位点受到了正选择作用(置信区间水平大于95％).表明正选择作用是维持黄嘴白鹭MHC Ⅱ类B基因的多态性的机制之一.
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