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目的:46XY完全性腺发育不全(46,XYCGD),旧称为46XY性逆转,是一种罕见病,其临床特点是46XY的核型、正常的女性外生殖器、完全未发育的性腺(“条纹状”性腺)、存在正常的苗勒管结构.患者有增加患肾母细胞瘤和生殖细胞瘤的风险(约30%),通常为双侧肿瘤.在这篇文章中,我们报道了1例患有原发闭经和单侧混合生殖细胞瘤的46,XY女性,患者双亲均不具有该病的任何临床特征,该研究的目的是诊断患者的遗传病因.方法:目前的基因诊断是通过对患者个体进行单个基因的直接测序,这种诊断方法效率低、成本高且检测周期长.在本研究中,通过目标区域捕获和基于新一代测序的平台分析对先证者及其父母进行基因检测.目标区域包括300多个DSD相关的基因的外显子及及内含子邻近区域,共1.5Mbp.为验证通过目标NGS获得的结果,对患者的所有家庭成员进行了候选突变的Sanger测序.结果:在46,XY CGD相关的8个基因上,该患者中检出26个突变.过滤掉UTR、内含子上的突变及同义突变后,剩下5个突变.由于46,X丫完全性腺发育不全的发病率是1∶20,000,因此在千人基因组数据库中频率≥0.01的突变可以排除.最后,位于SRY基因HMG域的编码区230位的一个单核苷酸的插入突变被检出,即(c.230_231 insA),该突变导致该基因编码蛋白形成截短蛋白(p.Lys77fsX27).该突变位于丫染色体的2655414位,有127个reads支持,该突变没有在1092名对照人群的内部数据库中检出.并且该突变没有在患者双亲中检出,表明该突变是一个de novo突变.为了进一步验证该突变,在患者及患者的父亲和弟弟中进行了Sanger测序验证,结果与目标区域捕获测序结果一致,患者表型正常的弟弟该位点为野生型.所有结果表明SRY基因上的新发突变很可能是导致该46,XYCGD患者患病的原因.结论:对于多基因参与的高度异质性疾病,新一代测序技术结合目标区域捕获技术是诊断该类疾病致病因素的最有效的途径.