早在1835年,Ehrenberg就发现并命名了枯草芽胞杆菌Vibrio subtilis.1872年,德国植物学家Cohn建立了第一个细菌分类系统,根据细菌的形态特征命名了芽胞杆菌属(Bacillus),并将枯草芽胞杆菌重命名为Bacillus subtilis.起初芽胞杆菌属的种类很少,随着技术研究方法的改进发展,越来越多的种被发现,尤其是上世纪70年代的分子分类法和80年代的化学分类法的应用,种的鉴定数量增多,分类地位确定的也越来越准确.从2004年5月至2007年5月为止发现的芽胞杆菌属的新种有49个,见表1.不同的文献来源,由于收集统计的时间、范围、内容、分类体系等的差异,所收集的芽胞杆菌种名数量不同.有的分类系统名录将芽胞杆菌分为一个属,如2005年核准种名目录(Approved Lists)收集的芽胞杆菌种名有175个,2006年NCBI数据库上收集的芽胞杆菌种名有182个,2006年德国菌种保存中心种名目录(DSMZ)收集的芽胞杆菌种名有187个；有的分类系统将芽胞杆菌分为20多个属,如2004年出版的第九版《伯杰氏细菌系统学手册：原核生物分类纲要》将芽胞杆菌类细菌分为35个属,记述了芽胞杆菌属及其近缘属在内的芽胞杆菌共409种,其中有91个种是同物异名.刘波在出版的《芽胞杆菌文献研究》中列出了244种芽胞杆菌.芽胞杆菌在工业、农业、医学方面有重要的作用.芽胞杆菌属的分类研究最初是根据形态学特征、培养特征及生理生化特征等表观分类学指证.随着多相分类方法的广泛采用,化学分类和分子分类在芽胞杆菌属的分类学研究中起到越来越重要的作用.本文综述了各种分类法在芽胞杆菌分类中的应用及作用.目前,不少芽胞杆菌应用到工业、农业和医学等领域上,对人类及社会做出了巨大贡献.随着科技的发展,芽胞杆菌和人们的关系越来越密切,逐步成为人类社会极为关注的一个微生物类群.采用现代分类手段对芽胞杆菌进行分类研究可望获得已知芽胞杆菌的一些生产应用或者潜在应用价值的菌株,并对建立相应的芽胞杆菌资源库和数据库有重要的意义.