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目的：本试验研究了微生物固态生料发酵对棉籽粕中游离棉酚和蛋白质含量变化的影响。方法：利用12株菌固态生料发酵棉籽粕筛选出高效脱除棉酚菌株和产蛋白酶能力最佳的菌株；在此基础上进行菌种复配发酵棉籽粕。结果：结果表明：单一菌株棉籽粕固态发酵试验中地衣芽孢杆菌B12脱毒效果最佳，脱毒率为42.7%，水溶性蛋白含量8.2%，小肽含量4.19%；产蛋白酶能力较强菌株为Bs1和Bs3，蛋白酶酶活力分别为43.8 U／mL和43.6U／mL；混菌组合发酵中B12+Cu1组合脱毒率50.03%，水溶性蛋白含量9.11%，小肽含量6.98%，为最佳菌种组合。结论：混菌发酵效果优于单菌发酵。