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本文利用Y染色体非重组区(MSY)的SNPs标记(Y—SNPs)对中国13个地方水牛群体的Y染色体单倍型多样性进行研究，发现中国水牛存在5种Y染色体单倍型(YST1-YST5)，YST1的频率最高，为33.3％，YSTS单倍型频率最低，只有1个个体。YST1与其他单倍型的距离很近，而与江河型水牛Y染色体单倍型YR1分歧很大，表明中国水牛具有有限的父系起源，沼泽型水牛可能是在中国独立驯化的。在中国水牛中还检测到9.72％的江河型水牛Y染色体单倍型，表明中国地方水牛存在江河型水牛的基因渗入现象。