全要素生产率提升是驱动经济高质量发展的重要途径，也是推动城市经济转型升级的基本动能。本文在综合已有文献基础上，根据2000 ～2017年长三角地区41个地级以上城市的面板数据，利用结合了数据包络分析(DEA)和随机前沿分析(SFA)优势的StoNED模型测算了长三角地级以上城市的全要素生产率及动态变化情况。结果 表明：①长三角地级以上城市全要素生产率上海市居首，江苏、浙江次之，安徽省居后，但整体全要素生产率水平在逐步趋于稳定；②安徽省的各大城市同江浙沪城市的全要素生产率还存在较大差距，安徽省要想融入长三角一体化城市进程中，还需要积极转变经济发展方式，促进产业结构升级，切实提高生产力水平；③同等城市规模下，大城市中全要素生产率排名靠前的城市主要来自江浙两省，且生产率普遍较高，排名靠后的城市均来自安徽省。安徽省应加强与周边江浙地区发达城市的联系，进一步提高经济资源配置的效率；④通过对长三角城市全要素生产率进行的时空分析可知，长三角地级以上城市生产率位序变动比较平稳；江苏省和长三角整体地区的全要素生产率变化有明显的收敛趋势，而浙江省和安徽省的全要素生产率收敛趋势不明显。