中国南海和莫雷阿岛珊瑚礁共生的微生物菌群分析比较

来源 :2015中国遗传学会大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaofyk
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  海洋微环境包含了丰富的生物,珊瑚礁就是其中一种。对珊瑚礁共生的微生物群落组成分析能够回答珊瑚共生体的关键生态学问题。微生物群落结构与环境因子之间的关系也能为物质循环提供重要的线索。在本研究中,我们收集了地理学位置较远的中国南海和莫里阿岛的珊瑚礁共生体微生物群落的测序数据。从NCBI下载数据集SRR82519和SRP007926,数据集中共有25个样本,其中17个珊瑚礁样本根据来源可以分成7组:Porites Iutea(P1),Galaxea fascicularis(Gf),Acropora millepora(Am),Paopao Bay, Fore reef,Back reef和Fringing reef,前三组来自中国南海,后面四组来自莫里阿岛;其余的样本为莫里阿岛离海岸的海水样本。每个样本的序列条数在554和23858之间。
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