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[学位论文] 作者：牛北方,
来源：中国科学院软件研究所 年份：2009
基因组测序是生物信息学最基本、最重要的研究领域之一。在测序的过程中，生物信息学手段是完成序列组装和比对分析的关键。第二代测序技术的出现，使个体基因组测序成为可能。但......
[会议论文] 作者：牛北方,
来源：第四届数学、计算机与生命科学交叉研究青年学者论坛 年份：2016
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[期刊论文] 作者：张裕, 牛北方,,
来源：科研信息化技术与应用 年份：2004
信息技术的迅猛发展使得单机服务器已很难满足企业和科研中多租户、多任务的计算需求,如何有效地组织和协调多机进行服务同时屏蔽底层实现细节、减少用户的学习和使用成本则...
[期刊论文] 作者：王德保,
来源：做人与处世 年份：2017
在中国的十二生肖中，真正起核心作用的是牛和马，其他的生肖或想象或凶猛，或嬌小或敏捷，都难以发挥更多的作用，做牛做马是不少人一生的标记，也是人类历史发展的符号。 南方的牛更多的是与田地相伴，田地就是生活的全部。一步一步在泥泞中行进，除了鞭子与呵斥，还有更多的......
[期刊论文] 作者：郭新,牛北方,
来源：计算机工程 年份：2009
基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作，提出一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案。该方案对所要进行比对分析的大规模序列库按某种策...
[期刊论文] 作者：夏宗逊,
来源：今日畜牧兽医：奶牛 年份：2010
“燕山雪花大如席,纷纷吹落轩辕台。”去年寒冷的冬季以及百年不遇的大雪．让养牛人感到了从未有过的寒冷．让我们的奶牛备受煎熬。有的牛场因大雪压垮了牛棚，造成奶牛伤亡和其它......
[期刊论文] 作者：何小雨,韩鑫胤,牛北方,
来源：计算机系统应用 年份：2021
细胞受到致癌因子刺激时引起突变,突变过程使基因组发生具有一定模式的改变,称为突变印迹.突变印迹分析是阐明致癌因子的致癌机制及驱动癌症发展的一项重要任务,将为肿瘤早期诊断和个体化治疗提供新的依据和选择.下一代测序技术的突破和发展使得海量体细胞突变......
[期刊论文] 作者：何志鹏,李瑞琳,牛北方,
来源：计算机科学 年份：2021
下一代测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)以其低成本、超高通量的特性,显著推动着宏基因组学的发展,同时也为领域内科研人员带来了巨大的挑战。随之而来的大规模、高...
[期刊论文] 作者：何小雨,邓笋根,栾海晶,牛北方,
来源：大数据 年份：2021
国家高性能计算环境的特点是广域分散、系统异构、存储资源隔离自治,这对存储设备管理、数据跨域共享等提出了极大的挑战。首先阐述了虚拟数据空间系统的概念,然后分析了其作...
[期刊论文] 作者：牛北方,郎显宇,陆忠华,迟学斌,,
来源：计算机应用研究 年份：2008
对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能。......
[会议论文] 作者：牛北方,郎显宇,陆忠华,迟学斌,
来源：中国科学院计算技术研究所第八届计算机科学与技术研究生学术讨论会 年份：2004
基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作,提出了一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案.这种方案对所要进行比对分析的大规模序列库按照...
[会议论文] 作者：牛北方,郎显宇,陆忠华,迟学斌,
来源：第8届全国并行计算大会 年份：2004
经证实，人类基因数目只有3万个左右,这甚至比一些植物的还少，但在进化水平上人类却无疑高级得多,人们推测一个重要原因是人类基因大量(35％以上)涉及mRNA可变剪接，mRNA的可变剪接......
[期刊论文] 作者：郎显宇,牛北方,沈斌,陆忠华,迟学斌,
来源：计算机研究与发展 年份：2005
分子空间结构相似性比较的指标函数可以定量地描述两个分子空间结构相似性大小,但难题在于如何确定分子初始相对位置,以保证得到全局最优叠合.由于以往都是利用程序随机生成...
[期刊论文] 作者：陈玮,赵丹,李晓东,何小雨,李瑞琳,牛北方,
来源：计算机系统应用 年份：2018
微卫星是广泛分布在真核生物基因组中的短串联重复序列.微卫星不稳定(Microsatellite Instability,MSI)是指由DNA错配修复系统故障引起的微卫星区域重复序列插入或缺失的现象...
[期刊论文] 作者：秦广军,肖利民,张广艳,牛北方,陈志广,
来源：大数据 年份：2021
高性能计算环境是支撑国家科技创新、经济发展、国防建设的核心信息基础设施,世界高性能计算强国纷纷建设基于多超算中心资源的广域高性能计算环境。然而,高性能计算环境中资...
[期刊论文] 作者：祝海栋, 李瑞琳, 何小雨, 赵丹, 韩鑫胤, 牛北方,,
来源：计算机系统应用 年份：2019
野生小麦是异源六倍体,基因组规模较大(约14 GB),且包含大量重复序列.为了培育具有优良性状的新品种,首先要定位控制目标性状的基因,因此建立一个完整准确的基因组注释软件流...
[会议论文] 作者：李瑞琳,何小雨,陈玮,郎显宇,Weizhong Li,牛北方,
来源：第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会 年份：2016
An increasing number of microbial genomes are being sequenced and deposited in public databases.Building non-redundant reference sequence database through e...
[期刊论文] 作者：牛北方,张西广,刘涛,郎显宇,陆忠华,迟学斌,
来源：计算机工程 年份：2009
针对新型超高通量测序仪Solexa测序仪所产生的测序片段read的比对与组装问题,提出一种短序列比对与组装算法SRMA,采用对参考序列进行hash的方法,将测序片段read分3段快速、准...
[期刊论文] 作者：朱骥,杨华,牛北方,郎显宇,陆忠华,迟学斌,,
来源：计算机应用研究 年份：2006
Motif在转录和后转录水平的基因表达调控中起着重要的作用。目前,识别Motif的算法和相应的软件已有不少,但是却鲜有对各种算法及软件性能共同评测的研究和报告。介绍了算法的分类以及三种常见的Mo-tif识别算法W ordup,MM和G ibbs采样,并对A lignACE,MEME,MotifS......
[期刊论文] 作者：代闯闯,栾海晶,杨雪莹,过晓冰,陆忠华,牛北方,
来源：计算机科学 年份：2021
随着比特币等虚拟数字货币的日益普及与发展,区块链技术受到了研究人员的广泛关注。区块链技术是一种按照时间顺序将区块以链式结构组合而成的分布式数据账本,具有去中心化、可编程、可溯源、不可篡改等特性,在金融领域中的研究尤为广泛。文章面向区块链技术的......
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