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对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能。
mRNA可变剪接问题的并行化研究
【摘 要】
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对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能。
【机 构】
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中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心,中国科学院研究生院
【出 处】
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计算机应用研究
【发表日期】
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2008年03期
【基金项目】
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国家“863”计划资助项目（2002AA104540）,国家自然科学基金资助项目（60533020）,国家科技部资助项目（2005DKA64002）
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