乙型肝炎病毒(hepatitis B virus，HBV)慢性感染是其相关肝病发生、进展的根本原因。HBV基因与宿主基因的整合不一定是病毒复制的必要环节，但越来越多的研究表明HBV基因整合事件可发生于病毒感染宿主的不同疾病阶段。HBV基因整合事件可能是影响包括HBV慢性感染、慢性乙型肝炎、肝硬化、肝细胞癌等肝脏疾病发生、发展的重要因素之一。HBV基因整合可诱导宿主对HBV免疫耐受，从而导致病毒感染慢性化；HBV基因组中HBV X区、HBV前S和S片段与宿主基因的整合事件最为常见，这与肝硬化和肝细胞癌的发生密切相关。HBV基因易与宿主端粒反转录酶、赖氨酸甲基转移酶2B和细胞周期E1等基因发生整合，并影响这些基因的转录，进一步引起其他相关基因的功能紊乱。针对HBV基因整合事件，可通过Sanger法测序和HBV捕获测序的方式进行测定研究；虽然越来越多的HBV基因整合事件在二代测序研究中被发现，但HBV基因与宿主基因整合的机制尚未明确。整合事件对疾病的发生、转归和对宿主基因活动的影响仍不清楚，需深入、细致的研究。