为揭示化肥减量与生物有机肥配施对土壤质量变化及马铃薯生长发育的影响规律，2019—2021年，通过田间定位试验，利用生理生化和磷脂脂肪酸（PLFAs）等技术手段，设置对照不施肥（CK）、单施化肥（T1）、单施生物有机肥（T2）、80%化肥+20%生物有机肥（T3）、60%化肥+40%生物有机肥（T4）5个处理，研究化肥减量与不同比例生物有机肥配施对土壤养分、酶活性、微生物群落结构以及马铃薯产量与品质的影响。结果表明：施肥处理较CK提高了土壤养分含量、酶活性，改变了土壤微生物群落结构，提高了马铃薯产量、品质及商品薯率。与T1、T2处理相比，T4处理土壤全氮含量分别显著提高5.56%、11.77%,碱解氮含量分别显著提高6.37%、12.29%;T4处理土壤脲酶活性分别显著提高20.69%、5.42%,过氧化氢酶活性分别显著提高28.81%、15.15%;T3处理土壤蔗糖酶活性分别显著提高41.40%、5.39%。化肥减量和生物有机肥配施处理显著提高了土壤细菌、革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌生物量以及细菌/真菌值，显著降低了真菌生物量；提高了薯块粗蛋白、淀粉、维生素C、还原糖含量以及鲜薯产量和商品薯率，其中T4处理淀粉含量显著（P＜0.05）高于T3处理，而薯块粗蛋白、维生素C、还原糖含量、鲜薯产量及商品薯率与T3处理相比均差异不显著。相关性分析表明，马铃薯产量、品质以及土壤微生物群落结构的变化受多种环境因子共同制约。由此可知，化肥减量与有机肥配施能够提升土壤养分质量，且能够提高鲜薯产量，改善鲜薯品质，其中60%化肥+40%生物有机肥组合效果优于80%化肥+20%生物有机肥。