胶质瘤中MAGE基因的生物信息学筛选分析及实验初步验证

来源 :基层医学论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hxt

【摘要】

：

目的筛选和验证与人脑胶质瘤相关的黑色素瘤抗原基因(Melanoma associated antigen genes,MAGE)家族成员。方法利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库筛选显著差异表达且

【作者】

：

张鹏博刘畅张庆梅陈芳李枫李冰滢农蔚霞肖绍文

【机构】

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广西医科大学第一附属医院,广西医科大学

【出处】

：

基层医学论坛

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

脑胶质瘤 MAGE家族MAGE-D4B TCGA QRT-PCR Brain glioma MAGE famHy MAGE-D4B TCGA qRT-PCR

【基金项目】

：

国家自然科学基金(No.81460382,No.81560408),广西自然科学基金(No.2017GXNSFAA198001),广西区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室课题(GKE-ZZ201908,GKE-ZZ202006),广西医科大学基础医学科技创新培育基金项目(GXMUBMSTC-T07,GXMUBMSTCF-G04,GXMUBMSTCF-G06,GXMUBMSTCF-G11)

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目的筛选和验证与人脑胶质瘤相关的黑色素瘤抗原基因(Melanoma associated antigen genes,MAGE)家族成员。方法利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库筛选显著差异表达且预后相关的MAGE基因,进而通过LinkedOmicsxSTRING.GO和KEGG等相关生物信息学方法对其中差异表达最显著的基因进行表达相关基因及其蛋白互作和功能富集分析,最后收集30例胶质瘤组织,通过实时逆转录定量PCR(Reverse-transcription quanti

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