八氢番茄红素脱氢酶的分子结构及其与达草灭相互作用分析

来源 :四川大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:yyandmwm
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八氢番茄红素脱氢酶(Phytoenedesaturase,PDS)是除草剂达草灭的靶点,作者对野生型和两种定点突变型PDS的二维和三维结构进行预测,并通过DOCK6.5进行PDS与达草灭的分子对接比较,利用Gromacs进行分子动力学模拟,使用Amber9中的inmpbsa.p1分析能量分布及变化,使用LIGPLOT+软件进行氢键分析确认结合氨基酸位点.结果表明突变对二维和三维结构无影响,但是在达草灭存在的情况下,突变的PDS有更高的结合能以及更弱的结合稳定性,更难以与达草灭结合,找到突变PDS蛋白对达草
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