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基于并行计算优化的WindSTORM PLUS算法

来源 :中国激光 | 被引量 : 2次 | 上传用户：xiaoxu0911

【摘 要】

：

随机光学重建显微镜(STORM)关键技术包括大量随机闪烁图像的数据定位与重建算法,而现有的常用开源算法在大数据量情况下存在用时过长或内存受限等限制,影响了STORM技术的进一步推广应用。基于MATLAB和并行计算的方法构建了WindSTORM PLUS开源算法,采用该算法进行单分子定位数据处理。在模拟数据集下,对比WindSTORM和ThunderSTORM,WindSTORM PLUS算法的处理

【作 者】

：

肖文 吴天琦 李仁剑 唐黎 陈玲玲 

【机 构】

：

深圳大学物理与光电工程学院,光电子器件与系统广东省/教育部重点实验室,广东深圳518060深圳技术大学健康与环境工程学院,广东深圳518118

【出 处】

：

中国激光

【发表日期】

：

2020年06期

【关键词】

：

显微 随机光学重建显微镜 并行计算 超分辨成像 图形处理器 microscopy stochastic optical reconstruction micro 

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随机光学重建显微镜(STORM)关键技术包括大量随机闪烁图像的数据定位与重建算法,而现有的常用开源算法在大数据量情况下存在用时过长或内存受限等限制,影响了STORM技术的进一步推广应用。基于MATLAB和并行计算的方法构建了WindSTORM PLUS开源算法,采用该算法进行单分子定位数据处理。在模拟数据集下,对比WindSTORM和ThunderSTORM,WindSTORM PLUS算法的处理速度提高了1000%,且对比WindSTORM,内存需求降低了60%。此外,搭建了easySTORM系统

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