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对十字花科葶苈族的辣根属、南芥族的豆瓣菜属及相关属种植物的叶绿体DNA的trnL内含子和trnL—F基因间隔区序列进行了测定分析。结果表明，辣根属植物与南芥族的山芥属、掉菜属、豆瓣菜属、碎米荠属在系统发育树中聚成一支，与葶苈族的模式属葶苈属植物相隔较远，结合形态特征，本研究认为辣根属应从葶苈族移出，其系统位置应靠近山芥属、薄菜属、豆瓣菜属、碎米荠属植物；此外，系统发育树中，豆瓣菜属植物并入碎米荠属中，表明二者具有更近的亲缘关系，本研究结果不支持《中国植物志》第33卷对辣根属和豆瓣菜属的系统位置的处理。