基于分子动力学模拟与分子对接技术的CD47抗原表位预测

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本文采用分子模拟技术预测CD47抗体的抗原结合表位及氨基酸残基理化性质,为下一步的抗体结构优化提供参考。使用Discovery Studio对CD47抗体C47B222、C47B161、B6H12.2进行同源建模,并对其结构合理性进行评估与分析。使用GROMACS进行分子动力学模拟,深入分析抗体结构的稳定性以及抗体互补性决定区(complementarity determining region, CDR)中柔性较高的氨基酸区域。最后利用ZDock方法将抗体与抗原分子进行刚性对接,分析抗原结合表位。结果显
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