目的 了解重庆市儿童群体中食源性疾病流行病学特征及病原体检出情况，为预防儿童感染性腹泻提供科学依据。方法 以2019-2021年重庆医科大学附属儿童医院采集的食源性疾病病例粪便标本进行沙门氏菌、副溶血性弧菌、志贺氏菌、致泻大肠埃希氏菌及诺如病毒的病原学检测，并对结果进行分析。结果2019-2021年共报告438例病例，采集标本354件，有126份标本检出阳性，检出率为35.59%，病原体检出情况为沙门氏菌103株（29.10%），致泻大肠埃希氏菌3株（0.85%），诺如病毒33株（9.32%），未分离出志贺氏菌和副溶血性弧菌，致病菌合并诺如病毒感染13例（3.67%）；病例主要集中在小于或等于5岁年龄段，阳性标本多集中在小于或等于2岁年龄段，占阳性标本总数的82.08%（食源性致病菌）和84.85%（诺如病毒）；可疑食品大部分来自家庭自制食品，占所有病例的71.92%。结论 重庆地区儿童食源性疾病病原体以沙门氏菌和诺如病毒为主，应有针对性地加强食品安全宣教健康教育，开展食源性疾病防控知识宣传，以降低食源性疾病的发生。