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针对基本微粒群优化算法（PSO）存在容易陷入局部最优和收敛速度慢的缺点,在整数空间使用带收缩因子的微粒群优化算法基础上,提出了一种带变异概率的微粒群优化算法（IPSO）,用于提高微粒群的多样性,避免算法陷入局部最优解。实验证明,改进后的微粒群优化算法在防止早熟和加快收敛方面优于基本PSO算法和基本PSO算法加一半微粒随机初始化算法（PSO_HPO算法）。IPSO算法应用到确定有机化合物分子式时,取得了很好的效果。