慢性鼻窦炎伴鼻息肉鼻黏膜上皮细胞基因转录组分析

来源 :中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ok524500
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

通过研究基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者与对照组鼻黏膜上皮细胞差异表达基因并分析其功能,寻找参与调控CRSwNP鼻黏膜上皮屏障功能损伤的关键基因。

方法

2018年6月至2020年5月,从可公开获得的GEO数据库下载编号为GSE107624(7例CRSwNP和7例对照)和GSE69093(13例CRSwNP和11例对照)的mRNA表达芯片数据,对两个数据集进行联合分析,筛选CRSwNP患者鼻黏膜上皮细胞差异表达基因,并对差异基因进行相互作用网络、功能注释和参与调控通路分析,根据基因注释结果筛选参与CRSwNP调控的重要基因。同期,收集首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科CRSwNP患者鼻息肉组织(14例,46.8±17.9岁)和鼻中隔偏曲患者的钩突黏膜组织(7例,23.4±2.3岁)作为对照组,对组织进行原代上皮细胞培养,并提取RNA进行实时荧光定量聚合酶链反应(Q-PCR)检测,对筛选出关键基因的mRNA表达水平进行验证。采用SPSS 22.0软件对数据进行统计学分析。

结果

GSE107624数据库中CRSwNP患者与对照组上皮细胞中差异基因为3 856个,GSE69093数据库中为771个。在2个数据库中,CRSwNP患者鼻黏膜上皮细胞同时表达上调的基因共55个,表达下调的基因共3个。对这58个基因进行GO基因功能注释分析发现SPTBN1FNBP1LVAPBSNX1参与细胞黏附功能,MAP1B参与微管相关复合体构成;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析发现BAMBISIAH1参与调节果蝇无翅/整合素(Wingless/Integrated,Wnt)通路,COL6A1EIF4E参与调节磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PI3K-AKT)通路;String蛋白相互作用网络分析发现微管相关蛋白1B(microtubule associated protein 1B,MAP1B)、VAMP相关蛋白B和C(VAMP associated protein B and C,VAPB)为核心功能蛋白。对筛选出差异倍数前3位基因(COL6A1MAP1BBAMBI)进行Q-PCR验证,MAP1B在CRSwNP患者鼻黏膜上皮细胞表达水平升高。

结论

CRSwNP鼻黏膜上皮细胞中表达水平升高的MAP1B基因,以及相关的Wnt、PI3K-AKT信号通路调控异常可能介导了CRSwNP鼻黏膜上皮细胞屏障功能障碍。

其他文献
目的 分析探讨临床接诊轮状病毒肠炎患儿在治疗过程中开展联合治疗(中医结合西医)对患儿病情的影响.方法 研究共抽取650例轮状病毒肠炎病例,来源时间为2018年1月至2020年1月,获得患儿完整资料后进行分析.分组方式结合实际开展治疗方式分为对照组(n=325,常规西医治疗)与观察组(n=325,中医结合西医),分析对比两组患儿经不同给药方式治疗前后生活质量、症状改善、血清IL-6与TNF-α以及治疗后起效时间.结果 ①分析两组患儿经不同给药方式干预前后生活质量改善情况:干预后观察组各项评分均高于对照组,两
目的评估锁骨上皮瓣修复头颈部缺损术后患者的肩功能变化。方法回顾性分析2013年1月至2020年12月首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科应用锁骨上皮瓣修复头颈部缺损56例患者的临床资料,其中男性54例,女性2例,年龄35~74岁,记录皮瓣面积、分型、供区切口是否裂开和感染等近期并发症情况。并应用快速上肢功能障碍简式评分表(quick disabilities of the arm,shou
目的 分析全身麻醉和腰硬联合麻醉对老年下肢骨折手术患者认知功能的影响.方法 将长春市中医院于2018年1月至2020年12月接收治疗的老年下肢骨折患者78例作为本次研究对象,用单盲法将78例患者分为观察组(腰硬联合组)和对照组(全麻组),每组各39例,对比分析两组患者各时段的心率、血压水平变化,术后MMSE、CAM评分,VAS评分、麻醉效果、Ramsay镇静评分、不良反应发生率.结果 观察组患者术后MMSE明显更高,CAM评分明显更低,对比统计学差异明显(P<0.05);Ramsay镇静评分、VAS评分更
目的 研究皮肤拉扣与传统皮肤间断缝合对额面部皮肤软组织挫裂伤口美观度的影响.方法 于2018年6月至2020年6月抽取东莞市东部中心医院收治的50例额面部皮肤软组织挫裂患者作为研究对象,按随机数字分配法将其分为对比组(实施传统皮肤间断缝合法缝合)和研究组(实施皮肤拉扣缝合法缝合),每组25例.对比两组的缝合时间、伤口愈合时间、伤口愈合分级、缝合美观度、并发症发生率(伤口裂开、红肿、脂肪液化、感染).结果 研究组的缝合时间、伤口愈合时间短于对比组,差异具有统计学意义(P<0.05).研究组的甲级愈合率为92
目的 探索糖尿病前期生活干预持久性的影响因素.方法 2019年6月至2020年6月,随机抽样选取378名泸州市、达州市、眉山市、成都市、广元市、长沙市、雅安市,攀枝花市2型糖尿病高危人群和已确诊的糖尿病前期患者,对其进行调查,受试者独立完成答卷.用Excel建立数据库,用SPSS 25.0软件对数据进行统计学分析.结果 多元线性回归进行分析得到:y=6.038-0.088qx-0.796hj-0.178js,根据t检验结果,环境和健身设备有统计学意义,P值分别为0.004和0.076,情绪差异无统计学意义
目的 研究关节镜清理联合胫骨高位内侧开放截骨治疗膝关节内侧间室骨关节炎的临床治疗效果.方法 选取2016年10月至2020年10月于内蒙古国药北方医院骨科就诊的膝关节内侧间室骨关节炎患者46例,将其分为观察组与对照组,对照组对其施行单纯的关节镜下清理方式进行治疗;观察组在对照组基础之上联合胫骨高位截骨对患者进行治疗,对比分析两组患者的临床治疗效果.结果 手术之后,观察组患者的截骨后股胫角(FTA)以及平台后倾角均有显著变化,且与术前相关数据差异对比均有统计学意义(P<0.05);观察组患者术后VAS评分、
目的 对盐酸法舒地尔用于急性脑梗死的临床治疗效果以及患者血清高敏C反应蛋白(hypersensitive C-reactive protein,hs-CRP)水平的影响进行分析.方法 选取2018年1月至2020年6月收治的52例急性脑梗死患者作为研究对象,按随机数字法将其分成常规组与观察组,各26例.常规组采用标准化常规西药治疗,观察组在常规组的基础上使用盐酸法舒地尔治疗,并对两组患者治疗前后的美国国立卫生院研究院卒中量表(NIH Stroke Scale,NIHSS)评分以及血清hs-CRP水平变化情
目的 探讨艾司西酞普兰在治疗慢性主观性头晕临床中的疗效.方法 选取我院2018~2019年收治慢性主观性头晕患者50例,随机将其分为两组,对照组采用常规前庭康复治疗,观察组给药艾司西酞普兰治疗.两组治疗前后分别用眩晕残障程度评定表、汉密尔顿焦虑量表、汉密尔顿抑郁量表进行评定效果,记录两组治疗前后的头晕症状发作频率与治疗结束后的有效例数,计算总有效率.结果 ①两组患者眩晕残障程度评定表:用眩晕残障程度评定表对两组患者治疗前后的情感、躯体、功能进行评定,对比两组的总分,观察组各项指标下降程度明显高于对照组,两
目的 比较无创通气与高流量湿化仪治疗呼吸衰竭病症的应用效果.方法 选择罗定市人民医院收治的40例呼吸衰竭患者,随机分为无创通气组22例和高流量湿化组18例,分别接受BIPAP模式无创通气和高流量湿化吸氧治疗,比较两组呼吸频率(RR)、心率(HR)、血气指标和痰液粘稠度.结果 治疗后高流量湿化组RR、HR均比无创通气组更低(P<0.05);两组治疗后的RR、HR都比同组治疗前低(P<0.05).PaO2、SaO2比较,两组治疗后均比同组治疗前高(P0.05).痰液粘稠度评分比较,治疗后高流量湿化组低于无创通
目的分析乳腺癌全乳房切除术后单纯区域复发(RR)患者的预后,探讨放疗的价值和靶区。方法回顾性分析2001—2018年间144例全乳房切除术后无辅助放疗、首次孤立性RR的乳腺癌患者,主要研究终点为再次局部区域复发(sLRR)、远处转移(DM)、无进展生存(PFS)和总生存(OS)。结果RR后中位随访82.5个月,全组患者5年sLRR、DM、PFS和OS分别为42.1%、71.9%、22.9%和62.