【摘 要】
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目的 基于网络药理学和分子对接技术探索雷公藤内酯(triptolide,TPL)治疗结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的分子作用机制.方法 分别通过Pubchem和PharmMapper数据库获得TPL的化学结构并预测药效团及作用靶点.通过GEO数据库获取CRC相关样本,进行差异表达分析.运用FunRich 3.1.3软件得到TPL作用靶点直肠癌差异基因的交集基因.通过STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制蛋白互作(PPI)网络和筛选出关键基因.借助Metascap
【机 构】
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桂林医学院药学院,广西桂林541199;广东莱恩医药研究院有限公司,广东省药物非临床评价研究企业重点实验室,国家中药现代化工程技术研究中心中药非临床评价分中心,广东省创新药物评价与研究工程技术研究中心
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目的 基于网络药理学和分子对接技术探索雷公藤内酯(triptolide,TPL)治疗结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的分子作用机制.方法 分别通过Pubchem和PharmMapper数据库获得TPL的化学结构并预测药效团及作用靶点.通过GEO数据库获取CRC相关样本,进行差异表达分析.运用FunRich 3.1.3软件得到TPL作用靶点直肠癌差异基因的交集基因.通过STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制蛋白互作(PPI)网络和筛选出关键基因.借助Metascape数据库对关键基因进行基因本体(gene ontology,GO)分子功能及基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes genomes,KEGG)富集分析.通过AutoDock Vina软件进行分子对接,将对接结果采用PyMol软件绘制.结果 将获得的282个TPL作用靶点与CRC显著差异的1087个靶点取其交集,共得到32个交集靶点,经过筛选后得到10个关键基因;GO功能和KEGG通路富集分析筛选出32条信号通路,包括Ras信号通路、PI3K-Akt信号通路等;分子对接结果显示,TPL与筛选出的核心靶点结合能均＜-7 kcal·mol-1,由此可知结合活性显著.结论 基于网络药理学及分子对接技术可以揭示TPL具有多靶点、多通路、多途径功能等特点,结果显示TPL可通过作用于CHEK1、MET、PLAU等基因调控相关信号通路,从而发挥对CRC的治疗作用.
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