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以14个烟草品种为试材，初步建立了适合于烟草AFLP分析的银染分析体系：烟草基因组的DNA提取采用CTAB法；地酶切连接同步进行；预扩增选用E＋A和M＋C引物；选择性扩增选用E＋3和M＋3引物；扩增产物利用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳，后用银染法检测。采用优化的体系，20对引物组合扩增出清晰的烟草AFLP图谱。