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对两种不同类型的异穗卷柏（Selaginella heterostachys Baker）药材的外观形态、孢子与茎的显微特征及近红外光谱特征进行了比较研究。结果表明：两类异穗卷柏的植株性状虽有明显不同，但其孢子形态、茎的解剖特征及近红外漫反射光谱特征一致。研究结果为异穗卷柏物种分类与药材鉴定提供了依据。