Perl语言整合5款软件进行真菌效应蛋白预测

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目的:效应蛋白在真菌与植物互作过程中发挥了重要的作用,它由真菌分泌进入植物体内引起植物细胞结构和功能改变,使植物表现出抗性抑制病菌侵染或者加速病菌侵染表现为感病。效应蛋白的预测目前尚无公认的方法,我们拟建立真菌效应蛋白预测流程,供研究人员参考。方法:根据真菌效应蛋白无典型结构及属于胞外分泌蛋白的特点,利用Perl语言整合5款软件(Signal P、Prot Comp、TMHMM、Target P、Wo LF PSORT),设计2种真菌效应蛋白预测方法。结果:对香蕉枯萎病菌蛋白质组进行测试,发现348个潜在
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