【摘 要】
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为研究红鳍东方鲀(Takfugu rubripes)不同生长阶段生长发育差异的分子机制,基于13与15月龄红鳍东方鲀的脑与肌肉组织转录组数据,以及在两时期间KEGG通路分析中差异显著的MAPK信号通路,结合基因互作分析对这期间发生的生物过程进行生物信息学方面的关联预测.结果 表明:MAPK信号通路通过调节fos和jun及其下游基因,促进这期间肌肉和骨骼发育,使红鳍东方鲀在两时期间生长.而fos和jun在两组织均上调,但在脑中抑制fos和jun的基因上调程度更高,而在肌肉中则较低.MAPK信号通路介导的eg
【机 构】
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大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023
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为研究红鳍东方鲀(Takfugu rubripes)不同生长阶段生长发育差异的分子机制,基于13与15月龄红鳍东方鲀的脑与肌肉组织转录组数据,以及在两时期间KEGG通路分析中差异显著的MAPK信号通路,结合基因互作分析对这期间发生的生物过程进行生物信息学方面的关联预测.结果 表明:MAPK信号通路通过调节fos和jun及其下游基因,促进这期间肌肉和骨骼发育,使红鳍东方鲀在两时期间生长.而fos和jun在两组织均上调,但在脑中抑制fos和jun的基因上调程度更高,而在肌肉中则较低.MAPK信号通路介导的egr1、c/ebpβ、ctgf等基因与骨骼发育相关,在此期间可能伴随着红鳍东方鲀骨骼的生长.MAPK信号通路还调节tgf-β、ctgf、pai1等与组织纤维化相关的基因,在转录层面上纤维化过程在肌肉中持续而在脑中减弱,可能促进了肌肉与骨骼的发育.MAPK信号通路还可能影响脂质代谢,即脑中7-氨基丁酸相关基因下调有促进脂肪积累的作用,该过程伴随着基础代谢降低.肌肉中核受体亚家族D组(nrld)基因的下调促进了脂质吸收,mstn6基因可能调节了这个过程.
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