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福柯的谱系学源于尼采，又有所发展，是其重要的研究方法。谱系学包括两大步骤，即首先追溯事物的出身，其次标出事物的发生。标出事物发生并非寻求普遍规则，而是要寻求构成事物的各个复合要素。这种方法是反形而上学的，表现在历史观上，则是消解线性历史观，质疑传统的理性进步观；表现在知识论上。则是将知识、真理和权力结构放在一起考察。