克罗恩病患者黏膜相关细菌群落多样性分析

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目的

了解克罗恩病患者同健康人群肠道黏膜相关细菌群落多样性差异。

方法

选择2010年9月至2011年12月在华西医院确诊的克罗恩病患者8例(克罗恩病组)和23名健康体检者(健康对照组),分别于结肠镜检查时取盲肠黏膜组织1块。末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)检测黏膜相关细菌多样性;聚类分析法比较菌群组成差异,比较两组菌群多样性及优势菌群组成差异,通过MiCA数据库寻找优势末端片段可能代表的细菌种类。

结果

聚类分析显示克罗恩病组与健康对照组黏膜相关细菌组成不同,各组内样本相似性明显高于组间样本。克罗恩病组细菌丰度HaeⅢ酶切和MspⅠ+HaeⅢ酶切显著峰数量(操作分类单元)均低于健康对照组[HaeⅢ:(7±4)比(10±8)个、P=0.048,MspⅠ+HaeⅢ:(20±10)比(24±12)个、P=0.036]。克罗恩病组Shannon-Wiener指数与健康对照组差异无统计学意义(1.7±0.7比2.0±0.5,P=0.220);克罗恩病组物种均匀度和Simpson指数均高于健康对照组(0.84±0.14比0.77±0.13、0.25±0.16比0.22±0.15,P=0.045、0.038)。在MspⅠ酶切分析中,37、40、66 bp为克罗恩病组特有优势末端片段;相对定量比较提示克罗恩病组35 bp含量高于健康对照组[36.8%(23.0%,55.4%)比14.3%(9.5%,19.5%),P=0.001];74、141、486、490 bp含量则均低于健康对照组[3.2%(1.3%,5.1%)比10.2%(5.4%,17.3%),4.5%(1.7%,7.1%)比10.8%(5.9%,21.1%),4.2%(1.6%,5.3%)比7.6%(5.9%,9.3%),3.6%(2.4%,6.1%)比18.3%(9.9%,43.2%),P=0.001、0.007、0.022、0.008]。克罗恩病组黏膜相关细菌以硬壁菌门、变形菌门、放线菌门为主;与健康对照组比较,克罗恩病患者中拟杆菌明显少,硬壁菌门中的肠杆菌属及放线菌属含量明显多。

结论

克罗恩病患者存在明显肠道菌群失调,黏膜相关细菌丰度及多样性减少,拟杆菌的减少和硬壁菌门中的肠杆菌属、放线菌属含量增加可能在克罗恩病的发生及发展中扮演重要作用。

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