一株新的变形杆菌噬菌体的分离、鉴定与生物学特性分析

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目的:一株新的变形杆菌噬菌体的分离、鉴定与生物学特性及基因组分析。方法:将实验室从牦牛屠宰环节中分离到的菌株纯培养后,对其DNA提取进行16SrRNA测序,鉴定获得宿主菌,采集成都牦牛屠宰场环境污水,以获得的宿主菌进行噬菌体分离;运用双层琼脂平板法进行噬菌体的分离纯化,测定噬菌体的最佳感染复数,一步生长曲线和噬菌体耐受性等;通过磷酸负染、透射电镜观察噬菌体的形态;采用试剂盒提取噬菌体全基因组DNA,使用IuminaMiseq测序平台进行噬菌体全基因组测序,对噬菌体全基因组序列进行组装、注释和基因组学分析。结果:从67株分离菌株中鉴定出10株变形杆菌,并从污水中分离得到一株可裂解变形杆菌和粪肠球菌并且裂解性较强的噬菌体,命名为ProteusphagePV66;其最佳感染复数为0.1,一步生长曲线结果显示,感染宿主菌的潜伏期约为10min,裂解期约为80min,平均裂解量为321PFU/cell;耐受pH范围为3-12,耐受温度为65℃。电镜观察该噬菌体为C3形态噬菌体,其头部长(140±1)nm,宽(54±2)nm,尾部长为(36±1)nm。基因组测序结果表明PV66全序列长度为90492bp,系统发育树分析发现该噬菌体与奇异变形杆菌噬菌体和克诺罗杆菌噬菌体同源性较高,与Non-Kuravirus属处于同一分支。结论:本研究分离到一株新的变形杆菌噬菌体并具有良好的应用潜力,为进一步开发噬菌体类新型抗菌剂提供基础,同时本研究也丰富了变形杆菌噬菌体的数据库。
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