基于生物信息学构建上皮性卵巢癌组织中miRNA-mRNA调控网络

来源 :中国优生与遗传杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yclmq
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 通过生物信息学构建上皮性卵巢(EOC)组织中miRNA-mRNA调控网络,以期为卵巢癌机制学研究提供研究思路。方法 选择GEO数据库中关于上皮性卵巢癌细胞外泌体及裂解物差异表达miRNA数据集GSE197892,选取其交集miRNA及各自表达显著的miRNA作为研究对象。应用在线分析网站预测其靶基因,并对其进行生物信息学分析,同时构建miRNA-mRNA调控网络。结果 外泌体组共筛选出的差异表达miRNA共30个,裂解物组共有32个,两组交集miRNA共有3个。外泌体组可筛选出3个显著差异表达miRNA,裂解物组则有4个。生物信息学分析显示,三组靶基因均于癌症通路中富集程度最高;同时,交集组靶基因于PTEN/Akt、FoxO等信号通路中显著富集;外泌体组靶基因于Hippo、Wnt等信号通路中显著富集;裂解物组靶基因则还显著富集于mTOR、MAPK等信号通路中。调控网络显示外泌体组、裂解物组、交集miRNA及其靶基因之间均有联系,多个靶基因可受多个miRNA的共同调控;同时,miR-214-3p及其靶基因FAT4、TMX4、SEMA4D、IGSF3及RRP7A处于调控网络的核心位置。结论 筛选出的miRNA及其核心基因可能成为上皮性卵巢癌预测及治疗的潜在靶点。
其他文献
【目的】:分析不同出血量的高血压性脑出血患者神经元特异性烯醇化酶的变化与患者神经功能缺损程度及其预后的相关性,为评估高血压性脑出血患者远期预后提供理论上的依据。【方法】:选取2021年1月至2021年12月延安大学咸阳医院神经外科收治的36例符合入排标准的脑出血患者,入院立即采集患者的临床资料、影像资料。根据出血量分为A组(20ml-30ml)、B组(30ml-40ml)。分别检测病例入院时(发病
针对人体生物学特点及户外步行助行要求,设计了一款下肢步行助力外骨骼机器人。为实现外骨骼机器人对人体下肢助力柔顺性目标,研究并提出了模糊自适应PID控制方法。在MATLAB/SIMULINK中搭建仿真模型,比较外骨骼关节力矩控制分别采用传统PID及模糊自适应PID控制算法的跟随效果。由仿真和试验结果可知,模糊自适应PID算法相较于经典PID算法具有响应速度快、超调量小等优点。模糊自适应PID算法对关
在强化学习中,智能体不断与环境交互并根据环境给出的评价式反馈信息学习最优控制策略。但是当环境没有提供反馈信息或是反馈信息不能准确地被量化时,强化学习方法的应用会受到很大限制。模仿学习是一种不依赖环境反馈信息的学习方法,其从专家示范轨迹中就能学得性能良好的控制策略。针对模仿学习方法的学习效率以及多模态模仿学习的性能问题,本文提出一种加快学习速度的框架以及提升多模态模仿学习性能的方法。主要的研究内容可
目的:利用生物信息学筛选出Graves病(GD)患者外周血B细胞中差异表达的miRNA,构建miRNA-mRNA调控网络,为GD治疗提供新靶点。方法:采用微阵列技术检测初发GD患者和健康受试者外周血CD19+B细胞中miRNA和mRNA表达谱。利用TargetScan和miRBase数据库对差异miRNA的靶基因进行预测,与差异mRNA取交集,筛选出目的靶基因。构建miRNA-mRNA差异表达网络
压力容器的设计主要采取常规设计法和可靠性设计法两种形式,常规设计法更加简单直观,但无法应用于未包含在规范中的其他容器结构设计中,不利于新型设备的研发和应用。从实际生产测试数据分析得出,影响压力容器强度以及载荷水平的外界因素较多,因此在进行压力容器设计时采用可靠性方法非常必要,也是压力容器设计的发展趋势。
试验采用了A-O中试反应器处理生活污水,在pH为8.5左右,氨氮浓度为300mg/L左右,严格控制溶解氧的情况,实现了短程硝化反硝化。结果表明,在反应初始阶段,通过严格控制反应器的DO浓度在0.5mg/L以下,运行一个月后,可以实现亚硝酸盐的积累,亚硝酸盐氮的积累率达到85%左右。稳定运行一段时间后,通过外加甲醇,亚硝酸盐氮逐渐较低,总氮去除率达到70%左右。
数据如何流通、共享,发挥其要素价值被更多地方利用到社会生产生活中是数字经济时代一个重要的问题。在数据的隐私性越来越受关注的时代,如何让互联网上大量的数据资源在不泄露隐私的条件下被用于深度学习模型训练能够有力推动数据的价值被充分挖掘。领域自适应研究如何解决在源域上训练的机器学习模型在遇到分布偏移的目标域时怎样提升模型在目标域数据上的性能的问题,近些年已经取得了很大进展。但是现有的领域自适应方法要求源
目的 研究妊娠期耳鼻喉疾病患者的临床护理干预措施及实施效果。方法 于本院治疗的妊娠期耳鼻喉疾病患者中遴选96例为探究对象,研究起止时间段为2020年8月-2021年8月,应用随机综合平衡法实施分组,组别为实验组(n=48)、对照组(n=48)。对照组在护理过程中采取常规护理,实验组采取综合护理干预方式,对于各组情绪状态、护理满意度、护理效果实施分析。结果 实验组护理后心理状态(HAMD、HAMA)
<正>一徐诗睿:汲老师,我最近要参加一个大学生职业生涯规划大赛,需要做一个有关“生涯人物”的访谈报告,想请教您几个问题,可以吗?汲安庆:这是一个很好的访谈主题。适恰的生涯规划,可以有效防止生命能量的耗散。我一定知无不言。徐诗睿:您认为要想成为一名优秀的中学语文教师,所需要的最核心的素养是什么?
期刊