【摘 要】
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为探究龙眼纤维素合成酶(cellulose synthase,CESA)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼C ESA (DICESA)家族成员鉴定、蛋白特性和保守基序分析、分子进化树分析
【机 构】
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福建农林大学园艺植物生物工程研究所 福州350002
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为探究龙眼纤维素合成酶(cellulose synthase,CESA)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼C ESA (DICESA)家族成员鉴定、蛋白特性和保守基序分析、分子进化树分析、FPKM值分析,并利用qRT-PCR技术分析DICESA基因的表达模式.结果表明,DICESA家族包含9个基因成员,家族成员内含子数量8-13个不等,且蛋白理化性质相近,均包含15个保守的motif;系统进化树分析表明DICESA分布于6个分支上;顺式作用元件分析表明DICESA家族启动子序列含有众多植物激素响应、厌氧响应等元件;FPKM值分析表明DICESA家族在NEC阶段高表达,大部分成员在体胚发生过程中呈现下调表达趋势;除DICESA7-2外其余DICESA基因在龙眼不同组织部位都有所表达.qRT-PCR分析表明,4个DICESA基因在非胚性阶段表达量较高;DICESA成员可被ABA和MeJA下调表达.本研究表明DICESA可能参与龙眼生殖生长和体胚发生进程,并响应逆境胁迫.
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