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吉林省农业科学院农业环境与资源研究中心组建于2003年6月，前身为土壤肥料研究所和农业综合研究所。农业环境与资源研究中心是以从事农业资源高效利用及农产品安全生产研究为主的公益性研究机构，是我院科技创新主体的重要组成部分。中心设有玉米栽培、耕作、旱作节水、植物营养、黑土资源、土壤生态、盐碱地改良、农业微生物、农产品安全及农业机械等学科。