陆地棉GhCRE1基因的生物信息学分析

来源 :农业科学与技术(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:tangroo
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细胞分裂素在植物的生长发育中起着非常重要的作用,CRE1已被鉴定为细胞分裂素受体,然而CRE1在棉花中的生物学功能尚不清楚.本文通过克隆GhCRE1基因,并对其序列进行生物信息学分析,发现GhCRE1基因有11个外显子和10个内含子;与可可和拟南芥两种植物同源基因相比,其分子量、pI和氨基酸数均不同,具有3个不同的蛋白结构域.通过多种生物信息学网站预测发现了15个与CRE1蛋白存在潜在相互作用的未鉴定蛋白和CRE1蛋白序列上的2个磷酸化位点.此外在CRE1启动子序列上发现了8个与光信号和激素相关的顺式作用元件.这些结果将有助于揭示该基因在陆地棉中的功能.“,”Cytokinin plays a very important role in plants growth and development, and CRE1 has been identified as a cytokinin receptor. However, the biological function of CRE1 in cotton remains unclear. In this paper, GhCRE1 gene was cloned and its sequence was analyzed by bioinformatics. The results revealed that GhCRE1 had 11 exons and 10 introns, and its molecular weight, theoretical isoelectric point (pI) and number of amino acids differed from those of the homologous gene in Theobroma cacao and Arabidopsis thaliana, with three different protein domains. 15 unidentified proteins were found in potential interaction with CRE1 protein and 2 phosphorylation sites on CRE1 protein sequence were predicted by mutiple bioinformatics websites. Additionally, 8 cis-acting regulatory elements were detected on CRE1 promoter sequence, and found related to light signal and hormone. These results were conducive to unfolding the function of GhCRE1 in upland cotton.
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